Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhox1B1APN4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhox1B1APN4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rhox1B1APN4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms