Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem238A9JSM3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms