Protein–RNA interactions for Protein: A2BI93

Ssxb9, Synovial sarcoma, X member B9, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ssxb9A2BI93 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Ssxb9A2BI93 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ssxb9A2BI93 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Ssxb9A2BI93 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Ssxb9A2BI93 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Ssxb9A2BI93 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Ssxb9A2BI93 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Ssxb9A2BI93 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Ssxb9A2BI93 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Ssxb9A2BI93 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssxb9A2BI93 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssxb9A2BI93 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms