Protein–RNA interactions for Protein: A2APU8

Fam205a, Protein FAM205A, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam205aA2APU8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam205aA2APU8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam205aA2APU8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam205aA2APU8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam205aA2APU8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam205aA2APU8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam205aA2APU8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam205aA2APU8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam205aA2APU8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam205aA2APU8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam205aA2APU8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam205aA2APU8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms