Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CtcflA2APF3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtcflA2APF3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtcflA2APF3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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