Protein–RNA interactions for Protein: A2ALK8

Ptpn3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn3A2ALK8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpn3A2ALK8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptpn3A2ALK8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn3A2ALK8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms