Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDK0

3110040M04Rik, Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110040M04RikA0A286YDK0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
3110040M04RikA0A286YDK0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
3110040M04RikA0A286YDK0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
3110040M04RikA0A286YDK0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms