Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms