Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp5Q9Z2P8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp5Q9Z2P8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vamp5Q9Z2P8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp5Q9Z2P8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp5Q9Z2P8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vamp5Q9Z2P8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp5Q9Z2P8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vamp5Q9Z2P8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vamp5Q9Z2P8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp5Q9Z2P8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp5Q9Z2P8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp5Q9Z2P8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp5Q9Z2P8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vamp5Q9Z2P8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vamp5Q9Z2P8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp5Q9Z2P8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vamp5Q9Z2P8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vamp5Q9Z2P8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vamp5Q9Z2P8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp5Q9Z2P8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vamp5Q9Z2P8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp5Q9Z2P8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp5Q9Z2P8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vamp5Q9Z2P8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp5Q9Z2P8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp5Q9Z2P8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp5Q9Z2P8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp5Q9Z2P8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp5Q9Z2P8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp5Q9Z2P8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vamp5Q9Z2P8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp5Q9Z2P8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp5Q9Z2P8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp5Q9Z2P8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp5Q9Z2P8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp5Q9Z2P8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp5Q9Z2P8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp5Q9Z2P8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp5Q9Z2P8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vamp5Q9Z2P8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp5Q9Z2P8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp5Q9Z2P8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp5Q9Z2P8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp5Q9Z2P8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vamp5Q9Z2P8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp5Q9Z2P8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp5Q9Z2P8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp5Q9Z2P8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp5Q9Z2P8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp5Q9Z2P8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp5Q9Z2P8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vamp5Q9Z2P8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp5Q9Z2P8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp5Q9Z2P8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp5Q9Z2P8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp5Q9Z2P8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vamp5Q9Z2P8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp5Q9Z2P8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp5Q9Z2P8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp5Q9Z2P8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp5Q9Z2P8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vamp5Q9Z2P8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp5Q9Z2P8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp5Q9Z2P8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vamp5Q9Z2P8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vamp5Q9Z2P8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vamp5Q9Z2P8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vamp5Q9Z2P8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vamp5Q9Z2P8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vamp5Q9Z2P8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vamp5Q9Z2P8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vamp5Q9Z2P8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vamp5Q9Z2P8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vamp5Q9Z2P8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp5Q9Z2P8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp5Q9Z2P8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp5Q9Z2P8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp5Q9Z2P8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp5Q9Z2P8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp5Q9Z2P8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vamp5Q9Z2P8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp5Q9Z2P8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp5Q9Z2P8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp5Q9Z2P8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp5Q9Z2P8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp5Q9Z2P8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp5Q9Z2P8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp5Q9Z2P8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp5Q9Z2P8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp5Q9Z2P8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp5Q9Z2P8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp5Q9Z2P8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vamp5Q9Z2P8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp5Q9Z2P8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp5Q9Z2P8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp5Q9Z2P8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms