Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Tulp1Q9Z273 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Tulp1Q9Z273 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Tulp1Q9Z273 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Tulp1Q9Z273 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Tulp1Q9Z273 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Tulp1Q9Z273 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Tulp1Q9Z273 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Tulp1Q9Z273 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Tulp1Q9Z273 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tulp1Q9Z273 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Tulp1Q9Z273 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Tulp1Q9Z273 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tulp1Q9Z273 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Tulp1Q9Z273 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tulp1Q9Z273 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tulp1Q9Z273 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Tulp1Q9Z273 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Tulp1Q9Z273 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tulp1Q9Z273 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tulp1Q9Z273 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tulp1Q9Z273 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tulp1Q9Z273 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tulp1Q9Z273 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Tulp1Q9Z273 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Tulp1Q9Z273 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tulp1Q9Z273 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Tulp1Q9Z273 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Tulp1Q9Z273 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Tulp1Q9Z273 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tulp1Q9Z273 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tulp1Q9Z273 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Tulp1Q9Z273 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tulp1Q9Z273 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tulp1Q9Z273 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tulp1Q9Z273 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tulp1Q9Z273 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tulp1Q9Z273 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Tulp1Q9Z273 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tulp1Q9Z273 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tulp1Q9Z273 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tulp1Q9Z273 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tulp1Q9Z273 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tulp1Q9Z273 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tulp1Q9Z273 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tulp1Q9Z273 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tulp1Q9Z273 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tulp1Q9Z273 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tulp1Q9Z273 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Tulp1Q9Z273 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tulp1Q9Z273 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tulp1Q9Z273 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tulp1Q9Z273 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tulp1Q9Z273 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tulp1Q9Z273 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tulp1Q9Z273 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tulp1Q9Z273 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tulp1Q9Z273 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tulp1Q9Z273 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tulp1Q9Z273 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tulp1Q9Z273 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tulp1Q9Z273 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tulp1Q9Z273 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tulp1Q9Z273 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tulp1Q9Z273 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Tulp1Q9Z273 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tulp1Q9Z273 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tulp1Q9Z273 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tulp1Q9Z273 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tulp1Q9Z273 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tulp1Q9Z273 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tulp1Q9Z273 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tulp1Q9Z273 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tulp1Q9Z273 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tulp1Q9Z273 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tulp1Q9Z273 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tulp1Q9Z273 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tulp1Q9Z273 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tulp1Q9Z273 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tulp1Q9Z273 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tulp1Q9Z273 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tulp1Q9Z273 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tulp1Q9Z273 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tulp1Q9Z273 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tulp1Q9Z273 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Tulp1Q9Z273 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tulp1Q9Z273 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tulp1Q9Z273 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tulp1Q9Z273 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tulp1Q9Z273 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Tulp1Q9Z273 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tulp1Q9Z273 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Tulp1Q9Z273 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tulp1Q9Z273 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Tulp1Q9Z273 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Tulp1Q9Z273 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tulp1Q9Z273 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Tulp1Q9Z273 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tulp1Q9Z273 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tulp1Q9Z273 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms