Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ilf3Q9Z1X4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ilf3Q9Z1X4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ilf3Q9Z1X4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ilf3Q9Z1X4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ilf3Q9Z1X4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ilf3Q9Z1X4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ilf3Q9Z1X4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ilf3Q9Z1X4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ilf3Q9Z1X4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ilf3Q9Z1X4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ilf3Q9Z1X4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ilf3Q9Z1X4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ilf3Q9Z1X4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ilf3Q9Z1X4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ilf3Q9Z1X4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ilf3Q9Z1X4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ilf3Q9Z1X4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ilf3Q9Z1X4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ilf3Q9Z1X4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ilf3Q9Z1X4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ilf3Q9Z1X4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ilf3Q9Z1X4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ilf3Q9Z1X4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ilf3Q9Z1X4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ilf3Q9Z1X4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ilf3Q9Z1X4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ilf3Q9Z1X4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ilf3Q9Z1X4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ilf3Q9Z1X4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ilf3Q9Z1X4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ilf3Q9Z1X4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ilf3Q9Z1X4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ilf3Q9Z1X4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ilf3Q9Z1X4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ilf3Q9Z1X4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ilf3Q9Z1X4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ilf3Q9Z1X4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ilf3Q9Z1X4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ilf3Q9Z1X4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ilf3Q9Z1X4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ilf3Q9Z1X4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ilf3Q9Z1X4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ilf3Q9Z1X4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ilf3Q9Z1X4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ilf3Q9Z1X4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ilf3Q9Z1X4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ilf3Q9Z1X4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ilf3Q9Z1X4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ilf3Q9Z1X4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ilf3Q9Z1X4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ilf3Q9Z1X4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ilf3Q9Z1X4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ilf3Q9Z1X4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ilf3Q9Z1X4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ilf3Q9Z1X4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ilf3Q9Z1X4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ilf3Q9Z1X4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ilf3Q9Z1X4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ilf3Q9Z1X4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ilf3Q9Z1X4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ilf3Q9Z1X4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ilf3Q9Z1X4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ilf3Q9Z1X4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ilf3Q9Z1X4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ilf3Q9Z1X4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ilf3Q9Z1X4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ilf3Q9Z1X4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ilf3Q9Z1X4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ilf3Q9Z1X4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ilf3Q9Z1X4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ilf3Q9Z1X4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ilf3Q9Z1X4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ilf3Q9Z1X4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ilf3Q9Z1X4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ilf3Q9Z1X4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ilf3Q9Z1X4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ilf3Q9Z1X4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ilf3Q9Z1X4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ilf3Q9Z1X4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ilf3Q9Z1X4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ilf3Q9Z1X4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ilf3Q9Z1X4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ilf3Q9Z1X4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ilf3Q9Z1X4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ilf3Q9Z1X4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ilf3Q9Z1X4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ilf3Q9Z1X4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ilf3Q9Z1X4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ilf3Q9Z1X4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ilf3Q9Z1X4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ilf3Q9Z1X4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ilf3Q9Z1X4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms