Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1S3

Rasgrp1, RAS guanyl-releasing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgrp1Q9Z1S3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rasgrp1Q9Z1S3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rasgrp1Q9Z1S3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rasgrp1Q9Z1S3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rasgrp1Q9Z1S3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rasgrp1Q9Z1S3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Rasgrp1Q9Z1S3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rasgrp1Q9Z1S3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rasgrp1Q9Z1S3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rasgrp1Q9Z1S3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rasgrp1Q9Z1S3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rasgrp1Q9Z1S3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rasgrp1Q9Z1S3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rasgrp1Q9Z1S3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rasgrp1Q9Z1S3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rasgrp1Q9Z1S3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rasgrp1Q9Z1S3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rasgrp1Q9Z1S3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rasgrp1Q9Z1S3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rasgrp1Q9Z1S3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rasgrp1Q9Z1S3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rasgrp1Q9Z1S3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rasgrp1Q9Z1S3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rasgrp1Q9Z1S3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Rasgrp1Q9Z1S3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rasgrp1Q9Z1S3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rasgrp1Q9Z1S3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rasgrp1Q9Z1S3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rasgrp1Q9Z1S3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rasgrp1Q9Z1S3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rasgrp1Q9Z1S3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rasgrp1Q9Z1S3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rasgrp1Q9Z1S3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Rasgrp1Q9Z1S3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rasgrp1Q9Z1S3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rasgrp1Q9Z1S3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rasgrp1Q9Z1S3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rasgrp1Q9Z1S3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rasgrp1Q9Z1S3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Rasgrp1Q9Z1S3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rasgrp1Q9Z1S3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rasgrp1Q9Z1S3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rasgrp1Q9Z1S3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rasgrp1Q9Z1S3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rasgrp1Q9Z1S3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rasgrp1Q9Z1S3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rasgrp1Q9Z1S3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Rasgrp1Q9Z1S3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rasgrp1Q9Z1S3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rasgrp1Q9Z1S3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rasgrp1Q9Z1S3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rasgrp1Q9Z1S3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rasgrp1Q9Z1S3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rasgrp1Q9Z1S3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rasgrp1Q9Z1S3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rasgrp1Q9Z1S3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rasgrp1Q9Z1S3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rasgrp1Q9Z1S3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rasgrp1Q9Z1S3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rasgrp1Q9Z1S3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rasgrp1Q9Z1S3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rasgrp1Q9Z1S3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rasgrp1Q9Z1S3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rasgrp1Q9Z1S3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rasgrp1Q9Z1S3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rasgrp1Q9Z1S3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Rasgrp1Q9Z1S3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rasgrp1Q9Z1S3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rasgrp1Q9Z1S3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rasgrp1Q9Z1S3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rasgrp1Q9Z1S3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rasgrp1Q9Z1S3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rasgrp1Q9Z1S3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rasgrp1Q9Z1S3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rasgrp1Q9Z1S3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rasgrp1Q9Z1S3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rasgrp1Q9Z1S3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rasgrp1Q9Z1S3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rasgrp1Q9Z1S3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rasgrp1Q9Z1S3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rasgrp1Q9Z1S3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rasgrp1Q9Z1S3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rasgrp1Q9Z1S3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rasgrp1Q9Z1S3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rasgrp1Q9Z1S3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rasgrp1Q9Z1S3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rasgrp1Q9Z1S3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rasgrp1Q9Z1S3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms