Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syngr4Q9Z1L2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syngr4Q9Z1L2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syngr4Q9Z1L2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syngr4Q9Z1L2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syngr4Q9Z1L2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syngr4Q9Z1L2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syngr4Q9Z1L2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syngr4Q9Z1L2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syngr4Q9Z1L2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Syngr4Q9Z1L2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syngr4Q9Z1L2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syngr4Q9Z1L2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syngr4Q9Z1L2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syngr4Q9Z1L2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syngr4Q9Z1L2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syngr4Q9Z1L2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syngr4Q9Z1L2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syngr4Q9Z1L2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syngr4Q9Z1L2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syngr4Q9Z1L2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syngr4Q9Z1L2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syngr4Q9Z1L2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syngr4Q9Z1L2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syngr4Q9Z1L2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syngr4Q9Z1L2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syngr4Q9Z1L2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syngr4Q9Z1L2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syngr4Q9Z1L2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syngr4Q9Z1L2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syngr4Q9Z1L2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syngr4Q9Z1L2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Syngr4Q9Z1L2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syngr4Q9Z1L2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syngr4Q9Z1L2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syngr4Q9Z1L2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syngr4Q9Z1L2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Syngr4Q9Z1L2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syngr4Q9Z1L2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Syngr4Q9Z1L2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syngr4Q9Z1L2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syngr4Q9Z1L2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syngr4Q9Z1L2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngr4Q9Z1L2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syngr4Q9Z1L2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syngr4Q9Z1L2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syngr4Q9Z1L2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syngr4Q9Z1L2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syngr4Q9Z1L2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syngr4Q9Z1L2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syngr4Q9Z1L2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syngr4Q9Z1L2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syngr4Q9Z1L2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syngr4Q9Z1L2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syngr4Q9Z1L2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngr4Q9Z1L2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Syngr4Q9Z1L2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syngr4Q9Z1L2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syngr4Q9Z1L2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syngr4Q9Z1L2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Syngr4Q9Z1L2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syngr4Q9Z1L2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Syngr4Q9Z1L2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syngr4Q9Z1L2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syngr4Q9Z1L2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syngr4Q9Z1L2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Syngr4Q9Z1L2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syngr4Q9Z1L2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Syngr4Q9Z1L2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syngr4Q9Z1L2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syngr4Q9Z1L2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syngr4Q9Z1L2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syngr4Q9Z1L2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syngr4Q9Z1L2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syngr4Q9Z1L2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syngr4Q9Z1L2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syngr4Q9Z1L2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syngr4Q9Z1L2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syngr4Q9Z1L2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syngr4Q9Z1L2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Syngr4Q9Z1L2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syngr4Q9Z1L2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syngr4Q9Z1L2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Syngr4Q9Z1L2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syngr4Q9Z1L2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syngr4Q9Z1L2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Syngr4Q9Z1L2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syngr4Q9Z1L2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syngr4Q9Z1L2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syngr4Q9Z1L2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syngr4Q9Z1L2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syngr4Q9Z1L2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syngr4Q9Z1L2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syngr4Q9Z1L2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syngr4Q9Z1L2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syngr4Q9Z1L2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syngr4Q9Z1L2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syngr4Q9Z1L2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Syngr4Q9Z1L2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.7 ms