Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cldn13Q9Z0S4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cldn13Q9Z0S4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cldn13Q9Z0S4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cldn13Q9Z0S4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cldn13Q9Z0S4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cldn13Q9Z0S4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cldn13Q9Z0S4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldn13Q9Z0S4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldn13Q9Z0S4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cldn13Q9Z0S4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cldn13Q9Z0S4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cldn13Q9Z0S4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cldn13Q9Z0S4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cldn13Q9Z0S4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cldn13Q9Z0S4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cldn13Q9Z0S4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cldn13Q9Z0S4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cldn13Q9Z0S4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cldn13Q9Z0S4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cldn13Q9Z0S4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cldn13Q9Z0S4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cldn13Q9Z0S4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cldn13Q9Z0S4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cldn13Q9Z0S4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cldn13Q9Z0S4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cldn13Q9Z0S4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cldn13Q9Z0S4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldn13Q9Z0S4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldn13Q9Z0S4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldn13Q9Z0S4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldn13Q9Z0S4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cldn13Q9Z0S4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cldn13Q9Z0S4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cldn13Q9Z0S4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldn13Q9Z0S4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn13Q9Z0S4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn13Q9Z0S4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldn13Q9Z0S4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldn13Q9Z0S4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldn13Q9Z0S4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn13Q9Z0S4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn13Q9Z0S4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn13Q9Z0S4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn13Q9Z0S4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn13Q9Z0S4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn13Q9Z0S4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn13Q9Z0S4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn13Q9Z0S4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn13Q9Z0S4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn13Q9Z0S4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn13Q9Z0S4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn13Q9Z0S4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn13Q9Z0S4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cldn13Q9Z0S4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn13Q9Z0S4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn13Q9Z0S4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn13Q9Z0S4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cldn13Q9Z0S4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn13Q9Z0S4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn13Q9Z0S4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn13Q9Z0S4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cldn13Q9Z0S4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn13Q9Z0S4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn13Q9Z0S4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn13Q9Z0S4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn13Q9Z0S4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cldn13Q9Z0S4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn13Q9Z0S4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn13Q9Z0S4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn13Q9Z0S4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn13Q9Z0S4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn13Q9Z0S4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn13Q9Z0S4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn13Q9Z0S4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn13Q9Z0S4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn13Q9Z0S4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn13Q9Z0S4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cldn13Q9Z0S4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn13Q9Z0S4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn13Q9Z0S4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn13Q9Z0S4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn13Q9Z0S4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn13Q9Z0S4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn13Q9Z0S4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldn13Q9Z0S4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn13Q9Z0S4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cldn13Q9Z0S4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn13Q9Z0S4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn13Q9Z0S4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn13Q9Z0S4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cldn13Q9Z0S4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn13Q9Z0S4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn13Q9Z0S4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn13Q9Z0S4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn13Q9Z0S4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.7 ms