Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cldn3Q9Z0G9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cldn3Q9Z0G9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cldn3Q9Z0G9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cldn3Q9Z0G9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cldn3Q9Z0G9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cldn3Q9Z0G9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cldn3Q9Z0G9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cldn3Q9Z0G9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cldn3Q9Z0G9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cldn3Q9Z0G9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cldn3Q9Z0G9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cldn3Q9Z0G9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cldn3Q9Z0G9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cldn3Q9Z0G9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cldn3Q9Z0G9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cldn3Q9Z0G9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cldn3Q9Z0G9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cldn3Q9Z0G9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cldn3Q9Z0G9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cldn3Q9Z0G9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cldn3Q9Z0G9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cldn3Q9Z0G9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cldn3Q9Z0G9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cldn3Q9Z0G9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cldn3Q9Z0G9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cldn3Q9Z0G9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cldn3Q9Z0G9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cldn3Q9Z0G9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cldn3Q9Z0G9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Cldn3Q9Z0G9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cldn3Q9Z0G9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cldn3Q9Z0G9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cldn3Q9Z0G9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cldn3Q9Z0G9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cldn3Q9Z0G9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cldn3Q9Z0G9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cldn3Q9Z0G9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cldn3Q9Z0G9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cldn3Q9Z0G9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cldn3Q9Z0G9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cldn3Q9Z0G9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cldn3Q9Z0G9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cldn3Q9Z0G9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cldn3Q9Z0G9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cldn3Q9Z0G9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cldn3Q9Z0G9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cldn3Q9Z0G9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cldn3Q9Z0G9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cldn3Q9Z0G9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cldn3Q9Z0G9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cldn3Q9Z0G9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cldn3Q9Z0G9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cldn3Q9Z0G9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cldn3Q9Z0G9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Cldn3Q9Z0G9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Cldn3Q9Z0G9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cldn3Q9Z0G9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cldn3Q9Z0G9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cldn3Q9Z0G9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Cldn3Q9Z0G9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cldn3Q9Z0G9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cldn3Q9Z0G9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cldn3Q9Z0G9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cldn3Q9Z0G9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cldn3Q9Z0G9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cldn3Q9Z0G9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cldn3Q9Z0G9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cldn3Q9Z0G9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cldn3Q9Z0G9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cldn3Q9Z0G9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cldn3Q9Z0G9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cldn3Q9Z0G9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cldn3Q9Z0G9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cldn3Q9Z0G9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cldn3Q9Z0G9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cldn3Q9Z0G9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cldn3Q9Z0G9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cldn3Q9Z0G9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cldn3Q9Z0G9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cldn3Q9Z0G9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cldn3Q9Z0G9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cldn3Q9Z0G9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cldn3Q9Z0G9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cldn3Q9Z0G9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cldn3Q9Z0G9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cldn3Q9Z0G9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cldn3Q9Z0G9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cldn3Q9Z0G9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cldn3Q9Z0G9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cldn3Q9Z0G9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cldn3Q9Z0G9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cldn3Q9Z0G9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cldn3Q9Z0G9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cldn3Q9Z0G9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cldn3Q9Z0G9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cldn3Q9Z0G9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cldn3Q9Z0G9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cldn3Q9Z0G9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms