Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pfdn5Q9WU28 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pfdn5Q9WU28 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pfdn5Q9WU28 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pfdn5Q9WU28 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pfdn5Q9WU28 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn5Q9WU28 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pfdn5Q9WU28 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pfdn5Q9WU28 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pfdn5Q9WU28 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pfdn5Q9WU28 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pfdn5Q9WU28 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pfdn5Q9WU28 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pfdn5Q9WU28 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pfdn5Q9WU28 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pfdn5Q9WU28 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pfdn5Q9WU28 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pfdn5Q9WU28 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pfdn5Q9WU28 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pfdn5Q9WU28 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pfdn5Q9WU28 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pfdn5Q9WU28 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pfdn5Q9WU28 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pfdn5Q9WU28 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pfdn5Q9WU28 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pfdn5Q9WU28 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pfdn5Q9WU28 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn5Q9WU28 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn5Q9WU28 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pfdn5Q9WU28 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfdn5Q9WU28 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfdn5Q9WU28 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfdn5Q9WU28 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pfdn5Q9WU28 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pfdn5Q9WU28 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfdn5Q9WU28 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pfdn5Q9WU28 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfdn5Q9WU28 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfdn5Q9WU28 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfdn5Q9WU28 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfdn5Q9WU28 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pfdn5Q9WU28 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pfdn5Q9WU28 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn5Q9WU28 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pfdn5Q9WU28 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pfdn5Q9WU28 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn5Q9WU28 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn5Q9WU28 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pfdn5Q9WU28 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn5Q9WU28 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn5Q9WU28 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn5Q9WU28 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pfdn5Q9WU28 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pfdn5Q9WU28 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pfdn5Q9WU28 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pfdn5Q9WU28 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pfdn5Q9WU28 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pfdn5Q9WU28 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pfdn5Q9WU28 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pfdn5Q9WU28 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pfdn5Q9WU28 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pfdn5Q9WU28 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pfdn5Q9WU28 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pfdn5Q9WU28 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pfdn5Q9WU28 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pfdn5Q9WU28 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pfdn5Q9WU28 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pfdn5Q9WU28 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfdn5Q9WU28 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfdn5Q9WU28 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfdn5Q9WU28 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pfdn5Q9WU28 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pfdn5Q9WU28 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pfdn5Q9WU28 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pfdn5Q9WU28 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pfdn5Q9WU28 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pfdn5Q9WU28 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pfdn5Q9WU28 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pfdn5Q9WU28 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pfdn5Q9WU28 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pfdn5Q9WU28 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pfdn5Q9WU28 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pfdn5Q9WU28 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pfdn5Q9WU28 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pfdn5Q9WU28 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pfdn5Q9WU28 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pfdn5Q9WU28 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pfdn5Q9WU28 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pfdn5Q9WU28 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pfdn5Q9WU28 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pfdn5Q9WU28 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pfdn5Q9WU28 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pfdn5Q9WU28 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pfdn5Q9WU28 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pfdn5Q9WU28 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pfdn5Q9WU28 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pfdn5Q9WU28 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pfdn5Q9WU28 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pfdn5Q9WU28 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pfdn5Q9WU28 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms