Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTY1

Pdcd7, Programmed cell death protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd7Q9WTY1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pdcd7Q9WTY1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pdcd7Q9WTY1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pdcd7Q9WTY1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pdcd7Q9WTY1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdcd7Q9WTY1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pdcd7Q9WTY1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pdcd7Q9WTY1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pdcd7Q9WTY1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pdcd7Q9WTY1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pdcd7Q9WTY1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pdcd7Q9WTY1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pdcd7Q9WTY1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pdcd7Q9WTY1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pdcd7Q9WTY1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pdcd7Q9WTY1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pdcd7Q9WTY1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pdcd7Q9WTY1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Pdcd7Q9WTY1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pdcd7Q9WTY1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdcd7Q9WTY1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pdcd7Q9WTY1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdcd7Q9WTY1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdcd7Q9WTY1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdcd7Q9WTY1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdcd7Q9WTY1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pdcd7Q9WTY1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdcd7Q9WTY1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdcd7Q9WTY1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Pdcd7Q9WTY1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdcd7Q9WTY1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdcd7Q9WTY1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pdcd7Q9WTY1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcd7Q9WTY1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd7Q9WTY1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdcd7Q9WTY1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcd7Q9WTY1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pdcd7Q9WTY1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdcd7Q9WTY1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pdcd7Q9WTY1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pdcd7Q9WTY1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdcd7Q9WTY1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdcd7Q9WTY1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pdcd7Q9WTY1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pdcd7Q9WTY1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pdcd7Q9WTY1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcd7Q9WTY1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Pdcd7Q9WTY1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Pdcd7Q9WTY1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pdcd7Q9WTY1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pdcd7Q9WTY1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pdcd7Q9WTY1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Pdcd7Q9WTY1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdcd7Q9WTY1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdcd7Q9WTY1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdcd7Q9WTY1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdcd7Q9WTY1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdcd7Q9WTY1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdcd7Q9WTY1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdcd7Q9WTY1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdcd7Q9WTY1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdcd7Q9WTY1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcd7Q9WTY1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdcd7Q9WTY1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdcd7Q9WTY1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdcd7Q9WTY1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pdcd7Q9WTY1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdcd7Q9WTY1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdcd7Q9WTY1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdcd7Q9WTY1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdcd7Q9WTY1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdcd7Q9WTY1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdcd7Q9WTY1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdcd7Q9WTY1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdcd7Q9WTY1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdcd7Q9WTY1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdcd7Q9WTY1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdcd7Q9WTY1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdcd7Q9WTY1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdcd7Q9WTY1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcd7Q9WTY1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pdcd7Q9WTY1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcd7Q9WTY1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcd7Q9WTY1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcd7Q9WTY1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdcd7Q9WTY1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcd7Q9WTY1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcd7Q9WTY1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcd7Q9WTY1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pdcd7Q9WTY1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd7Q9WTY1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd7Q9WTY1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pdcd7Q9WTY1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcd7Q9WTY1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pdcd7Q9WTY1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcd7Q9WTY1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcd7Q9WTY1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcd7Q9WTY1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pdcd7Q9WTY1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pdcd7Q9WTY1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms