Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTL2

Rab25, Ras-related protein Rab-25, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab25Q9WTL2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab25Q9WTL2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab25Q9WTL2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab25Q9WTL2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab25Q9WTL2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab25Q9WTL2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab25Q9WTL2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab25Q9WTL2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab25Q9WTL2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab25Q9WTL2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab25Q9WTL2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab25Q9WTL2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab25Q9WTL2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab25Q9WTL2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab25Q9WTL2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab25Q9WTL2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab25Q9WTL2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab25Q9WTL2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab25Q9WTL2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab25Q9WTL2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab25Q9WTL2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab25Q9WTL2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab25Q9WTL2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab25Q9WTL2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab25Q9WTL2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab25Q9WTL2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab25Q9WTL2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab25Q9WTL2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab25Q9WTL2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab25Q9WTL2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab25Q9WTL2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab25Q9WTL2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab25Q9WTL2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab25Q9WTL2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab25Q9WTL2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab25Q9WTL2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab25Q9WTL2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab25Q9WTL2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab25Q9WTL2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab25Q9WTL2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab25Q9WTL2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab25Q9WTL2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab25Q9WTL2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab25Q9WTL2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab25Q9WTL2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab25Q9WTL2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab25Q9WTL2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab25Q9WTL2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab25Q9WTL2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab25Q9WTL2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab25Q9WTL2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab25Q9WTL2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rab25Q9WTL2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab25Q9WTL2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab25Q9WTL2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab25Q9WTL2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab25Q9WTL2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab25Q9WTL2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab25Q9WTL2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab25Q9WTL2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab25Q9WTL2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab25Q9WTL2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab25Q9WTL2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab25Q9WTL2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab25Q9WTL2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab25Q9WTL2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab25Q9WTL2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab25Q9WTL2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab25Q9WTL2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab25Q9WTL2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab25Q9WTL2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab25Q9WTL2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab25Q9WTL2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab25Q9WTL2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab25Q9WTL2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab25Q9WTL2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab25Q9WTL2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab25Q9WTL2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab25Q9WTL2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab25Q9WTL2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab25Q9WTL2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab25Q9WTL2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab25Q9WTL2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab25Q9WTL2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab25Q9WTL2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab25Q9WTL2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab25Q9WTL2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab25Q9WTL2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab25Q9WTL2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab25Q9WTL2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab25Q9WTL2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab25Q9WTL2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab25Q9WTL2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab25Q9WTL2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab25Q9WTL2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab25Q9WTL2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab25Q9WTL2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab25Q9WTL2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab25Q9WTL2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab25Q9WTL2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms