Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK8

Nmu, Neuromedin-U, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmuQ9QXK8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NmuQ9QXK8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NmuQ9QXK8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NmuQ9QXK8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NmuQ9QXK8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NmuQ9QXK8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NmuQ9QXK8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NmuQ9QXK8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NmuQ9QXK8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NmuQ9QXK8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NmuQ9QXK8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NmuQ9QXK8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NmuQ9QXK8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NmuQ9QXK8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NmuQ9QXK8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NmuQ9QXK8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NmuQ9QXK8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NmuQ9QXK8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NmuQ9QXK8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NmuQ9QXK8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NmuQ9QXK8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NmuQ9QXK8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NmuQ9QXK8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NmuQ9QXK8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NmuQ9QXK8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NmuQ9QXK8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NmuQ9QXK8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NmuQ9QXK8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NmuQ9QXK8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NmuQ9QXK8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NmuQ9QXK8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NmuQ9QXK8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NmuQ9QXK8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NmuQ9QXK8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NmuQ9QXK8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NmuQ9QXK8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NmuQ9QXK8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NmuQ9QXK8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NmuQ9QXK8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NmuQ9QXK8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NmuQ9QXK8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NmuQ9QXK8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NmuQ9QXK8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NmuQ9QXK8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NmuQ9QXK8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NmuQ9QXK8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NmuQ9QXK8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NmuQ9QXK8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NmuQ9QXK8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NmuQ9QXK8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NmuQ9QXK8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NmuQ9QXK8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NmuQ9QXK8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NmuQ9QXK8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NmuQ9QXK8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NmuQ9QXK8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NmuQ9QXK8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NmuQ9QXK8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NmuQ9QXK8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NmuQ9QXK8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NmuQ9QXK8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NmuQ9QXK8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NmuQ9QXK8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NmuQ9QXK8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NmuQ9QXK8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NmuQ9QXK8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NmuQ9QXK8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NmuQ9QXK8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NmuQ9QXK8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NmuQ9QXK8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NmuQ9QXK8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NmuQ9QXK8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NmuQ9QXK8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NmuQ9QXK8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NmuQ9QXK8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NmuQ9QXK8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NmuQ9QXK8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NmuQ9QXK8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NmuQ9QXK8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NmuQ9QXK8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NmuQ9QXK8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NmuQ9QXK8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NmuQ9QXK8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NmuQ9QXK8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NmuQ9QXK8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NmuQ9QXK8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NmuQ9QXK8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NmuQ9QXK8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NmuQ9QXK8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NmuQ9QXK8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NmuQ9QXK8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NmuQ9QXK8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NmuQ9QXK8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NmuQ9QXK8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NmuQ9QXK8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NmuQ9QXK8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NmuQ9QXK8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NmuQ9QXK8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NmuQ9QXK8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NmuQ9QXK8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms