Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sh3bgrlQ9JJU8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3bgrlQ9JJU8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bgrlQ9JJU8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3bgrlQ9JJU8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3bgrlQ9JJU8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3bgrlQ9JJU8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bgrlQ9JJU8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sh3bgrlQ9JJU8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bgrlQ9JJU8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3bgrlQ9JJU8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bgrlQ9JJU8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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