Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Ush1cQ9ES64 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ush1cQ9ES64 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ush1cQ9ES64 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ush1cQ9ES64 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ush1cQ9ES64 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ush1cQ9ES64 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ush1cQ9ES64 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ush1cQ9ES64 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ush1cQ9ES64 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ush1cQ9ES64 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ush1cQ9ES64 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ush1cQ9ES64 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Ush1cQ9ES64 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Ush1cQ9ES64 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Ush1cQ9ES64 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ush1cQ9ES64 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ush1cQ9ES64 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ush1cQ9ES64 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ush1cQ9ES64 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ush1cQ9ES64 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ush1cQ9ES64 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ush1cQ9ES64 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ush1cQ9ES64 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ush1cQ9ES64 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ush1cQ9ES64 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Ush1cQ9ES64 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ush1cQ9ES64 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ush1cQ9ES64 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ush1cQ9ES64 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ush1cQ9ES64 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ush1cQ9ES64 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ush1cQ9ES64 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ush1cQ9ES64 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ush1cQ9ES64 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ush1cQ9ES64 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ush1cQ9ES64 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ush1cQ9ES64 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ush1cQ9ES64 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ush1cQ9ES64 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ush1cQ9ES64 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ush1cQ9ES64 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ush1cQ9ES64 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ush1cQ9ES64 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ush1cQ9ES64 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ush1cQ9ES64 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ush1cQ9ES64 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ush1cQ9ES64 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ush1cQ9ES64 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ush1cQ9ES64 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ush1cQ9ES64 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ush1cQ9ES64 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ush1cQ9ES64 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ush1cQ9ES64 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ush1cQ9ES64 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ush1cQ9ES64 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ush1cQ9ES64 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ush1cQ9ES64 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ush1cQ9ES64 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ush1cQ9ES64 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ush1cQ9ES64 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Ush1cQ9ES64 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Ush1cQ9ES64 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ush1cQ9ES64 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ush1cQ9ES64 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ush1cQ9ES64 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ush1cQ9ES64 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ush1cQ9ES64 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ush1cQ9ES64 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ush1cQ9ES64 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ush1cQ9ES64 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Ush1cQ9ES64 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ush1cQ9ES64 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ush1cQ9ES64 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Ush1cQ9ES64 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Ush1cQ9ES64 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ush1cQ9ES64 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ush1cQ9ES64 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ush1cQ9ES64 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ush1cQ9ES64 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ush1cQ9ES64 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ush1cQ9ES64 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ush1cQ9ES64 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ush1cQ9ES64 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ush1cQ9ES64 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ush1cQ9ES64 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ush1cQ9ES64 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ush1cQ9ES64 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ush1cQ9ES64 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ush1cQ9ES64 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ush1cQ9ES64 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ush1cQ9ES64 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ush1cQ9ES64 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ush1cQ9ES64 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ush1cQ9ES64 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ush1cQ9ES64 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ush1cQ9ES64 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ush1cQ9ES64 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ush1cQ9ES64 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ush1cQ9ES64 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms