Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dap3Q9ER88 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dap3Q9ER88 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dap3Q9ER88 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dap3Q9ER88 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dap3Q9ER88 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dap3Q9ER88 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dap3Q9ER88 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dap3Q9ER88 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dap3Q9ER88 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dap3Q9ER88 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Dap3Q9ER88 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dap3Q9ER88 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Dap3Q9ER88 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dap3Q9ER88 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dap3Q9ER88 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dap3Q9ER88 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dap3Q9ER88 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dap3Q9ER88 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dap3Q9ER88 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dap3Q9ER88 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dap3Q9ER88 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Dap3Q9ER88 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dap3Q9ER88 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dap3Q9ER88 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dap3Q9ER88 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dap3Q9ER88 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dap3Q9ER88 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Dap3Q9ER88 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dap3Q9ER88 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dap3Q9ER88 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dap3Q9ER88 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dap3Q9ER88 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dap3Q9ER88 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dap3Q9ER88 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dap3Q9ER88 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dap3Q9ER88 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dap3Q9ER88 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Dap3Q9ER88 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dap3Q9ER88 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dap3Q9ER88 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dap3Q9ER88 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dap3Q9ER88 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dap3Q9ER88 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dap3Q9ER88 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dap3Q9ER88 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dap3Q9ER88 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dap3Q9ER88 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dap3Q9ER88 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dap3Q9ER88 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dap3Q9ER88 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dap3Q9ER88 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dap3Q9ER88 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dap3Q9ER88 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dap3Q9ER88 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dap3Q9ER88 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dap3Q9ER88 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dap3Q9ER88 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dap3Q9ER88 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dap3Q9ER88 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Dap3Q9ER88 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dap3Q9ER88 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Dap3Q9ER88 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dap3Q9ER88 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dap3Q9ER88 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dap3Q9ER88 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dap3Q9ER88 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dap3Q9ER88 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Dap3Q9ER88 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dap3Q9ER88 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Dap3Q9ER88 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dap3Q9ER88 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dap3Q9ER88 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dap3Q9ER88 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dap3Q9ER88 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dap3Q9ER88 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dap3Q9ER88 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dap3Q9ER88 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dap3Q9ER88 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dap3Q9ER88 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Dap3Q9ER88 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dap3Q9ER88 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dap3Q9ER88 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dap3Q9ER88 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dap3Q9ER88 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Dap3Q9ER88 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dap3Q9ER88 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dap3Q9ER88 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dap3Q9ER88 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dap3Q9ER88 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dap3Q9ER88 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dap3Q9ER88 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dap3Q9ER88 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dap3Q9ER88 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dap3Q9ER88 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dap3Q9ER88 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dap3Q9ER88 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dap3Q9ER88 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dap3Q9ER88 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dap3Q9ER88 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms