Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ44

Vmn1r41, Vomeronasal type-1 receptor 41, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r41Q9EQ44 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn1r41Q9EQ44 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r41Q9EQ44 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn1r41Q9EQ44 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn1r41Q9EQ44 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r41Q9EQ44 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn1r41Q9EQ44 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn1r41Q9EQ44 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn1r41Q9EQ44 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn1r41Q9EQ44 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn1r41Q9EQ44 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn1r41Q9EQ44 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r41Q9EQ44 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r41Q9EQ44 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r41Q9EQ44 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn1r41Q9EQ44 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn1r41Q9EQ44 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn1r41Q9EQ44 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r41Q9EQ44 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r41Q9EQ44 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vmn1r41Q9EQ44 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r41Q9EQ44 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r41Q9EQ44 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r41Q9EQ44 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r41Q9EQ44 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r41Q9EQ44 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r41Q9EQ44 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r41Q9EQ44 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r41Q9EQ44 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r41Q9EQ44 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r41Q9EQ44 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r41Q9EQ44 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r41Q9EQ44 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r41Q9EQ44 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r41Q9EQ44 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r41Q9EQ44 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r41Q9EQ44 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r41Q9EQ44 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r41Q9EQ44 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r41Q9EQ44 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r41Q9EQ44 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r41Q9EQ44 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r41Q9EQ44 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r41Q9EQ44 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r41Q9EQ44 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r41Q9EQ44 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r41Q9EQ44 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Vmn1r41Q9EQ44 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r41Q9EQ44 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r41Q9EQ44 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r41Q9EQ44 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r41Q9EQ44 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r41Q9EQ44 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r41Q9EQ44 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r41Q9EQ44 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r41Q9EQ44 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r41Q9EQ44 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r41Q9EQ44 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r41Q9EQ44 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r41Q9EQ44 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r41Q9EQ44 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r41Q9EQ44 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r41Q9EQ44 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r41Q9EQ44 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r41Q9EQ44 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r41Q9EQ44 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r41Q9EQ44 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r41Q9EQ44 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r41Q9EQ44 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r41Q9EQ44 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r41Q9EQ44 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r41Q9EQ44 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r41Q9EQ44 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r41Q9EQ44 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r41Q9EQ44 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r41Q9EQ44 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r41Q9EQ44 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r41Q9EQ44 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r41Q9EQ44 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r41Q9EQ44 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r41Q9EQ44 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r41Q9EQ44 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r41Q9EQ44 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r41Q9EQ44 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r41Q9EQ44 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r41Q9EQ44 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r41Q9EQ44 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r41Q9EQ44 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r41Q9EQ44 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r41Q9EQ44 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r41Q9EQ44 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r41Q9EQ44 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r41Q9EQ44 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r41Q9EQ44 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r41Q9EQ44 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r41Q9EQ44 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r41Q9EQ44 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r41Q9EQ44 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r41Q9EQ44 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r41Q9EQ44 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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