Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Fip1l1Q9D824 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Fip1l1Q9D824 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fip1l1Q9D824 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fip1l1Q9D824 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fip1l1Q9D824 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fip1l1Q9D824 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fip1l1Q9D824 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fip1l1Q9D824 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fip1l1Q9D824 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fip1l1Q9D824 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fip1l1Q9D824 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fip1l1Q9D824 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fip1l1Q9D824 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fip1l1Q9D824 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fip1l1Q9D824 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fip1l1Q9D824 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fip1l1Q9D824 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fip1l1Q9D824 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fip1l1Q9D824 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fip1l1Q9D824 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fip1l1Q9D824 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fip1l1Q9D824 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fip1l1Q9D824 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fip1l1Q9D824 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fip1l1Q9D824 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fip1l1Q9D824 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fip1l1Q9D824 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fip1l1Q9D824 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fip1l1Q9D824 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fip1l1Q9D824 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Fip1l1Q9D824 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fip1l1Q9D824 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fip1l1Q9D824 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fip1l1Q9D824 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fip1l1Q9D824 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Fip1l1Q9D824 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fip1l1Q9D824 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fip1l1Q9D824 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fip1l1Q9D824 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fip1l1Q9D824 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fip1l1Q9D824 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fip1l1Q9D824 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fip1l1Q9D824 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Fip1l1Q9D824 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fip1l1Q9D824 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fip1l1Q9D824 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fip1l1Q9D824 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fip1l1Q9D824 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fip1l1Q9D824 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fip1l1Q9D824 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fip1l1Q9D824 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fip1l1Q9D824 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fip1l1Q9D824 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fip1l1Q9D824 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Fip1l1Q9D824 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Fip1l1Q9D824 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fip1l1Q9D824 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fip1l1Q9D824 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fip1l1Q9D824 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fip1l1Q9D824 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fip1l1Q9D824 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fip1l1Q9D824 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fip1l1Q9D824 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fip1l1Q9D824 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fip1l1Q9D824 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fip1l1Q9D824 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fip1l1Q9D824 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fip1l1Q9D824 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Fip1l1Q9D824 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fip1l1Q9D824 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fip1l1Q9D824 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fip1l1Q9D824 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fip1l1Q9D824 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fip1l1Q9D824 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fip1l1Q9D824 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fip1l1Q9D824 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fip1l1Q9D824 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fip1l1Q9D824 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fip1l1Q9D824 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fip1l1Q9D824 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fip1l1Q9D824 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fip1l1Q9D824 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fip1l1Q9D824 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fip1l1Q9D824 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fip1l1Q9D824 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fip1l1Q9D824 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fip1l1Q9D824 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fip1l1Q9D824 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fip1l1Q9D824 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fip1l1Q9D824 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fip1l1Q9D824 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fip1l1Q9D824 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fip1l1Q9D824 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fip1l1Q9D824 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fip1l1Q9D824 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fip1l1Q9D824 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fip1l1Q9D824 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fip1l1Q9D824 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fip1l1Q9D824 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms