Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D7E4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D7E4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D7E4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D7E4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D7E4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D7E4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D7E4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D7E4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D7E4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D7E4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D7E4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D7E4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D7E4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D7E4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q9D7E4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9D7E4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Q9D7E4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D7E4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D7E4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D7E4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D7E4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D7E4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D7E4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D7E4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D7E4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D7E4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9D7E4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9D7E4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D7E4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D7E4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D7E4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D7E4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D7E4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D7E4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9D7E4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D7E4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D7E4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D7E4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D7E4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D7E4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D7E4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D7E4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D7E4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D7E4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D7E4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D7E4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D7E4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D7E4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9D7E4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D7E4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9D7E4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9D7E4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D7E4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9D7E4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D7E4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9D7E4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D7E4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D7E4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9D7E4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D7E4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D7E4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D7E4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D7E4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D7E4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D7E4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D7E4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D7E4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D7E4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9D7E4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9D7E4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9D7E4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9D7E4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9D7E4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9D7E4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9D7E4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9D7E4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9D7E4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9D7E4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D7E4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D7E4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D7E4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9D7E4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9D7E4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9D7E4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9D7E4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D7E4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D7E4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9D7E4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D7E4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D7E4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D7E4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9D7E4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q9D7E4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Q9D7E4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D7E4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9D7E4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D7E4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D7E4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D7E4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms