Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Nsmce1Q9D720 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nsmce1Q9D720 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nsmce1Q9D720 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nsmce1Q9D720 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Nsmce1Q9D720 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nsmce1Q9D720 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nsmce1Q9D720 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nsmce1Q9D720 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nsmce1Q9D720 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nsmce1Q9D720 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nsmce1Q9D720 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nsmce1Q9D720 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nsmce1Q9D720 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nsmce1Q9D720 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nsmce1Q9D720 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nsmce1Q9D720 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nsmce1Q9D720 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nsmce1Q9D720 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nsmce1Q9D720 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nsmce1Q9D720 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nsmce1Q9D720 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nsmce1Q9D720 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nsmce1Q9D720 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nsmce1Q9D720 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nsmce1Q9D720 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nsmce1Q9D720 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nsmce1Q9D720 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nsmce1Q9D720 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nsmce1Q9D720 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nsmce1Q9D720 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nsmce1Q9D720 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nsmce1Q9D720 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nsmce1Q9D720 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Nsmce1Q9D720 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nsmce1Q9D720 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nsmce1Q9D720 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nsmce1Q9D720 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nsmce1Q9D720 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nsmce1Q9D720 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Nsmce1Q9D720 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nsmce1Q9D720 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nsmce1Q9D720 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nsmce1Q9D720 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nsmce1Q9D720 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nsmce1Q9D720 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nsmce1Q9D720 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nsmce1Q9D720 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nsmce1Q9D720 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nsmce1Q9D720 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nsmce1Q9D720 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nsmce1Q9D720 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nsmce1Q9D720 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nsmce1Q9D720 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nsmce1Q9D720 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nsmce1Q9D720 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nsmce1Q9D720 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nsmce1Q9D720 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nsmce1Q9D720 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nsmce1Q9D720 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Nsmce1Q9D720 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Nsmce1Q9D720 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nsmce1Q9D720 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nsmce1Q9D720 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nsmce1Q9D720 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Nsmce1Q9D720 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nsmce1Q9D720 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nsmce1Q9D720 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nsmce1Q9D720 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Nsmce1Q9D720 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nsmce1Q9D720 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Nsmce1Q9D720 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nsmce1Q9D720 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nsmce1Q9D720 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nsmce1Q9D720 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Nsmce1Q9D720 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nsmce1Q9D720 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Nsmce1Q9D720 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nsmce1Q9D720 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nsmce1Q9D720 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nsmce1Q9D720 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nsmce1Q9D720 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nsmce1Q9D720 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nsmce1Q9D720 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Nsmce1Q9D720 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nsmce1Q9D720 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nsmce1Q9D720 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nsmce1Q9D720 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nsmce1Q9D720 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nsmce1Q9D720 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nsmce1Q9D720 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nsmce1Q9D720 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nsmce1Q9D720 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nsmce1Q9D720 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nsmce1Q9D720 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nsmce1Q9D720 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nsmce1Q9D720 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nsmce1Q9D720 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nsmce1Q9D720 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nsmce1Q9D720 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms