Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nop56Q9D6Z1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nop56Q9D6Z1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nop56Q9D6Z1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nop56Q9D6Z1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nop56Q9D6Z1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nop56Q9D6Z1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nop56Q9D6Z1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nop56Q9D6Z1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nop56Q9D6Z1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nop56Q9D6Z1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nop56Q9D6Z1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nop56Q9D6Z1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nop56Q9D6Z1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Nop56Q9D6Z1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nop56Q9D6Z1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nop56Q9D6Z1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nop56Q9D6Z1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nop56Q9D6Z1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nop56Q9D6Z1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nop56Q9D6Z1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nop56Q9D6Z1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Nop56Q9D6Z1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Nop56Q9D6Z1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nop56Q9D6Z1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Nop56Q9D6Z1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nop56Q9D6Z1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nop56Q9D6Z1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nop56Q9D6Z1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nop56Q9D6Z1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nop56Q9D6Z1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nop56Q9D6Z1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nop56Q9D6Z1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nop56Q9D6Z1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nop56Q9D6Z1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nop56Q9D6Z1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nop56Q9D6Z1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Nop56Q9D6Z1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nop56Q9D6Z1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nop56Q9D6Z1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nop56Q9D6Z1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nop56Q9D6Z1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nop56Q9D6Z1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nop56Q9D6Z1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Nop56Q9D6Z1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nop56Q9D6Z1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Nop56Q9D6Z1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Nop56Q9D6Z1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nop56Q9D6Z1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nop56Q9D6Z1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nop56Q9D6Z1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nop56Q9D6Z1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nop56Q9D6Z1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nop56Q9D6Z1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nop56Q9D6Z1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nop56Q9D6Z1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nop56Q9D6Z1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nop56Q9D6Z1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nop56Q9D6Z1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nop56Q9D6Z1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nop56Q9D6Z1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Nop56Q9D6Z1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Nop56Q9D6Z1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nop56Q9D6Z1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nop56Q9D6Z1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nop56Q9D6Z1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nop56Q9D6Z1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nop56Q9D6Z1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nop56Q9D6Z1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nop56Q9D6Z1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nop56Q9D6Z1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nop56Q9D6Z1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nop56Q9D6Z1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nop56Q9D6Z1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nop56Q9D6Z1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nop56Q9D6Z1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nop56Q9D6Z1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nop56Q9D6Z1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nop56Q9D6Z1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nop56Q9D6Z1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nop56Q9D6Z1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nop56Q9D6Z1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nop56Q9D6Z1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nop56Q9D6Z1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nop56Q9D6Z1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nop56Q9D6Z1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nop56Q9D6Z1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nop56Q9D6Z1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nop56Q9D6Z1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nop56Q9D6Z1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nop56Q9D6Z1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Nop56Q9D6Z1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nop56Q9D6Z1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nop56Q9D6Z1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nop56Q9D6Z1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nop56Q9D6Z1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nop56Q9D6Z1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nop56Q9D6Z1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nop56Q9D6Z1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nop56Q9D6Z1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms