Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V6

Syap1, Synapse-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syap1Q9D5V6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Syap1Q9D5V6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Syap1Q9D5V6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Syap1Q9D5V6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Syap1Q9D5V6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Syap1Q9D5V6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Syap1Q9D5V6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Syap1Q9D5V6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Syap1Q9D5V6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Syap1Q9D5V6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Syap1Q9D5V6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Syap1Q9D5V6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Syap1Q9D5V6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Syap1Q9D5V6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Syap1Q9D5V6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Syap1Q9D5V6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Syap1Q9D5V6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Syap1Q9D5V6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Syap1Q9D5V6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Syap1Q9D5V6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Syap1Q9D5V6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Syap1Q9D5V6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Syap1Q9D5V6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Syap1Q9D5V6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Syap1Q9D5V6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Syap1Q9D5V6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Syap1Q9D5V6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Syap1Q9D5V6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Syap1Q9D5V6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Syap1Q9D5V6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Syap1Q9D5V6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Syap1Q9D5V6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Syap1Q9D5V6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Syap1Q9D5V6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Syap1Q9D5V6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Syap1Q9D5V6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Syap1Q9D5V6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Syap1Q9D5V6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Syap1Q9D5V6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Syap1Q9D5V6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Syap1Q9D5V6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Syap1Q9D5V6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Syap1Q9D5V6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Syap1Q9D5V6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Syap1Q9D5V6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Syap1Q9D5V6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Syap1Q9D5V6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Syap1Q9D5V6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Syap1Q9D5V6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Syap1Q9D5V6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Syap1Q9D5V6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Syap1Q9D5V6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Syap1Q9D5V6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Syap1Q9D5V6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Syap1Q9D5V6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Syap1Q9D5V6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Syap1Q9D5V6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Syap1Q9D5V6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Syap1Q9D5V6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Syap1Q9D5V6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Syap1Q9D5V6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Syap1Q9D5V6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Syap1Q9D5V6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Syap1Q9D5V6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Syap1Q9D5V6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Syap1Q9D5V6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Syap1Q9D5V6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Syap1Q9D5V6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Syap1Q9D5V6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Syap1Q9D5V6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Syap1Q9D5V6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Syap1Q9D5V6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Syap1Q9D5V6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Syap1Q9D5V6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Syap1Q9D5V6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Syap1Q9D5V6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Syap1Q9D5V6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Syap1Q9D5V6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Syap1Q9D5V6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Syap1Q9D5V6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Syap1Q9D5V6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Syap1Q9D5V6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Syap1Q9D5V6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Syap1Q9D5V6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Syap1Q9D5V6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Syap1Q9D5V6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Syap1Q9D5V6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syap1Q9D5V6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syap1Q9D5V6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syap1Q9D5V6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syap1Q9D5V6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Syap1Q9D5V6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Syap1Q9D5V6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syap1Q9D5V6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syap1Q9D5V6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syap1Q9D5V6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syap1Q9D5V6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syap1Q9D5V6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syap1Q9D5V6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Syap1Q9D5V6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms