Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sf3a3Q9D554 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sf3a3Q9D554 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sf3a3Q9D554 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sf3a3Q9D554 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sf3a3Q9D554 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sf3a3Q9D554 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sf3a3Q9D554 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sf3a3Q9D554 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sf3a3Q9D554 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sf3a3Q9D554 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sf3a3Q9D554 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Sf3a3Q9D554 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sf3a3Q9D554 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sf3a3Q9D554 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3a3Q9D554 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3a3Q9D554 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sf3a3Q9D554 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sf3a3Q9D554 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3a3Q9D554 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sf3a3Q9D554 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sf3a3Q9D554 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sf3a3Q9D554 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sf3a3Q9D554 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sf3a3Q9D554 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sf3a3Q9D554 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sf3a3Q9D554 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sf3a3Q9D554 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Sf3a3Q9D554 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sf3a3Q9D554 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sf3a3Q9D554 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sf3a3Q9D554 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3a3Q9D554 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sf3a3Q9D554 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sf3a3Q9D554 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sf3a3Q9D554 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sf3a3Q9D554 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Sf3a3Q9D554 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sf3a3Q9D554 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sf3a3Q9D554 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sf3a3Q9D554 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sf3a3Q9D554 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sf3a3Q9D554 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sf3a3Q9D554 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sf3a3Q9D554 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sf3a3Q9D554 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sf3a3Q9D554 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sf3a3Q9D554 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sf3a3Q9D554 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sf3a3Q9D554 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Sf3a3Q9D554 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sf3a3Q9D554 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sf3a3Q9D554 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sf3a3Q9D554 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sf3a3Q9D554 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sf3a3Q9D554 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sf3a3Q9D554 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sf3a3Q9D554 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sf3a3Q9D554 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sf3a3Q9D554 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sf3a3Q9D554 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sf3a3Q9D554 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sf3a3Q9D554 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sf3a3Q9D554 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sf3a3Q9D554 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3a3Q9D554 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Sf3a3Q9D554 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sf3a3Q9D554 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sf3a3Q9D554 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sf3a3Q9D554 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sf3a3Q9D554 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3a3Q9D554 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3a3Q9D554 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3a3Q9D554 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sf3a3Q9D554 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sf3a3Q9D554 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sf3a3Q9D554 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sf3a3Q9D554 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sf3a3Q9D554 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sf3a3Q9D554 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sf3a3Q9D554 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sf3a3Q9D554 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sf3a3Q9D554 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sf3a3Q9D554 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sf3a3Q9D554 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sf3a3Q9D554 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sf3a3Q9D554 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Sf3a3Q9D554 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sf3a3Q9D554 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sf3a3Q9D554 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sf3a3Q9D554 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sf3a3Q9D554 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sf3a3Q9D554 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sf3a3Q9D554 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sf3a3Q9D554 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sf3a3Q9D554 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sf3a3Q9D554 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3a3Q9D554 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3a3Q9D554 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sf3a3Q9D554 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms