Protein–RNA interactions for Protein: Q9D476

4933407L21Rik, RIKEN cDNA 4933407L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933407L21RikQ9D476 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933407L21RikQ9D476 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
4933407L21RikQ9D476 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933407L21RikQ9D476 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933407L21RikQ9D476 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933407L21RikQ9D476 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933407L21RikQ9D476 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933407L21RikQ9D476 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933407L21RikQ9D476 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933407L21RikQ9D476 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933407L21RikQ9D476 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933407L21RikQ9D476 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
4933407L21RikQ9D476 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933407L21RikQ9D476 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933407L21RikQ9D476 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933407L21RikQ9D476 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
4933407L21RikQ9D476 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933407L21RikQ9D476 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933407L21RikQ9D476 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933407L21RikQ9D476 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933407L21RikQ9D476 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933407L21RikQ9D476 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933407L21RikQ9D476 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933407L21RikQ9D476 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933407L21RikQ9D476 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933407L21RikQ9D476 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933407L21RikQ9D476 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933407L21RikQ9D476 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933407L21RikQ9D476 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933407L21RikQ9D476 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933407L21RikQ9D476 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933407L21RikQ9D476 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933407L21RikQ9D476 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
4933407L21RikQ9D476 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4933407L21RikQ9D476 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933407L21RikQ9D476 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933407L21RikQ9D476 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933407L21RikQ9D476 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933407L21RikQ9D476 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933407L21RikQ9D476 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933407L21RikQ9D476 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933407L21RikQ9D476 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933407L21RikQ9D476 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933407L21RikQ9D476 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933407L21RikQ9D476 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933407L21RikQ9D476 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933407L21RikQ9D476 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933407L21RikQ9D476 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933407L21RikQ9D476 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933407L21RikQ9D476 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933407L21RikQ9D476 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933407L21RikQ9D476 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933407L21RikQ9D476 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933407L21RikQ9D476 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933407L21RikQ9D476 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933407L21RikQ9D476 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933407L21RikQ9D476 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933407L21RikQ9D476 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933407L21RikQ9D476 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933407L21RikQ9D476 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22■■□□□ 1.11
4933407L21RikQ9D476 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933407L21RikQ9D476 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933407L21RikQ9D476 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933407L21RikQ9D476 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
4933407L21RikQ9D476 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933407L21RikQ9D476 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933407L21RikQ9D476 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933407L21RikQ9D476 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933407L21RikQ9D476 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933407L21RikQ9D476 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933407L21RikQ9D476 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
4933407L21RikQ9D476 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
4933407L21RikQ9D476 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4933407L21RikQ9D476 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933407L21RikQ9D476 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933407L21RikQ9D476 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4933407L21RikQ9D476 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4933407L21RikQ9D476 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4933407L21RikQ9D476 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933407L21RikQ9D476 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933407L21RikQ9D476 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4933407L21RikQ9D476 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933407L21RikQ9D476 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4933407L21RikQ9D476 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933407L21RikQ9D476 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4933407L21RikQ9D476 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4933407L21RikQ9D476 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933407L21RikQ9D476 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
4933407L21RikQ9D476 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4933407L21RikQ9D476 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4933407L21RikQ9D476 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4933407L21RikQ9D476 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
4933407L21RikQ9D476 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
4933407L21RikQ9D476 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4933407L21RikQ9D476 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4933407L21RikQ9D476 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933407L21RikQ9D476 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4933407L21RikQ9D476 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933407L21RikQ9D476 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4933407L21RikQ9D476 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms