Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl52Q9D0Y8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mrpl52Q9D0Y8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl52Q9D0Y8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mrpl52Q9D0Y8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mrpl52Q9D0Y8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mrpl52Q9D0Y8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl52Q9D0Y8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl52Q9D0Y8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl52Q9D0Y8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mrpl52Q9D0Y8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl52Q9D0Y8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl52Q9D0Y8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mrpl52Q9D0Y8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl52Q9D0Y8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl52Q9D0Y8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl52Q9D0Y8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl52Q9D0Y8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl52Q9D0Y8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mrpl52Q9D0Y8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl52Q9D0Y8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl52Q9D0Y8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mrpl52Q9D0Y8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mrpl52Q9D0Y8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl52Q9D0Y8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl52Q9D0Y8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl52Q9D0Y8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl52Q9D0Y8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl52Q9D0Y8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mrpl52Q9D0Y8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl52Q9D0Y8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl52Q9D0Y8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl52Q9D0Y8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl52Q9D0Y8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl52Q9D0Y8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl52Q9D0Y8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl52Q9D0Y8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl52Q9D0Y8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl52Q9D0Y8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl52Q9D0Y8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl52Q9D0Y8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl52Q9D0Y8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl52Q9D0Y8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mrpl52Q9D0Y8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl52Q9D0Y8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mrpl52Q9D0Y8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl52Q9D0Y8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl52Q9D0Y8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl52Q9D0Y8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mrpl52Q9D0Y8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mrpl52Q9D0Y8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mrpl52Q9D0Y8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mrpl52Q9D0Y8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mrpl52Q9D0Y8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl52Q9D0Y8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl52Q9D0Y8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mrpl52Q9D0Y8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl52Q9D0Y8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mrpl52Q9D0Y8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl52Q9D0Y8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl52Q9D0Y8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl52Q9D0Y8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl52Q9D0Y8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl52Q9D0Y8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl52Q9D0Y8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl52Q9D0Y8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl52Q9D0Y8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl52Q9D0Y8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl52Q9D0Y8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl52Q9D0Y8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl52Q9D0Y8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl52Q9D0Y8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl52Q9D0Y8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl52Q9D0Y8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mrpl52Q9D0Y8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mrpl52Q9D0Y8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mrpl52Q9D0Y8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl52Q9D0Y8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mrpl52Q9D0Y8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl52Q9D0Y8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl52Q9D0Y8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl52Q9D0Y8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl52Q9D0Y8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl52Q9D0Y8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl52Q9D0Y8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mrpl52Q9D0Y8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl52Q9D0Y8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms