Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29■■■□□ 2.23
Stx17Q9D0I4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stx17Q9D0I4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Stx17Q9D0I4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stx17Q9D0I4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Stx17Q9D0I4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stx17Q9D0I4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Stx17Q9D0I4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Stx17Q9D0I4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Stx17Q9D0I4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Stx17Q9D0I4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Stx17Q9D0I4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Stx17Q9D0I4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stx17Q9D0I4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Stx17Q9D0I4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stx17Q9D0I4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stx17Q9D0I4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stx17Q9D0I4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stx17Q9D0I4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stx17Q9D0I4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Stx17Q9D0I4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Stx17Q9D0I4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Stx17Q9D0I4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stx17Q9D0I4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Stx17Q9D0I4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Stx17Q9D0I4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stx17Q9D0I4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stx17Q9D0I4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Stx17Q9D0I4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Stx17Q9D0I4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stx17Q9D0I4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Stx17Q9D0I4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Stx17Q9D0I4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stx17Q9D0I4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stx17Q9D0I4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stx17Q9D0I4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Stx17Q9D0I4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Stx17Q9D0I4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Stx17Q9D0I4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stx17Q9D0I4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stx17Q9D0I4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Stx17Q9D0I4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Stx17Q9D0I4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stx17Q9D0I4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Stx17Q9D0I4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stx17Q9D0I4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Stx17Q9D0I4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stx17Q9D0I4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stx17Q9D0I4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stx17Q9D0I4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stx17Q9D0I4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stx17Q9D0I4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stx17Q9D0I4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stx17Q9D0I4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stx17Q9D0I4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stx17Q9D0I4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Stx17Q9D0I4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Stx17Q9D0I4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Stx17Q9D0I4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Stx17Q9D0I4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Stx17Q9D0I4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Stx17Q9D0I4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Stx17Q9D0I4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stx17Q9D0I4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stx17Q9D0I4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stx17Q9D0I4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Stx17Q9D0I4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Stx17Q9D0I4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stx17Q9D0I4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stx17Q9D0I4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stx17Q9D0I4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stx17Q9D0I4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stx17Q9D0I4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stx17Q9D0I4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stx17Q9D0I4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stx17Q9D0I4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stx17Q9D0I4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stx17Q9D0I4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stx17Q9D0I4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stx17Q9D0I4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stx17Q9D0I4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stx17Q9D0I4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stx17Q9D0I4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stx17Q9D0I4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stx17Q9D0I4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stx17Q9D0I4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stx17Q9D0I4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stx17Q9D0I4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stx17Q9D0I4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stx17Q9D0I4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stx17Q9D0I4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stx17Q9D0I4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stx17Q9D0I4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stx17Q9D0I4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stx17Q9D0I4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stx17Q9D0I4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stx17Q9D0I4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Stx17Q9D0I4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Stx17Q9D0I4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stx17Q9D0I4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms