Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ91

Srfbp1, Serum response factor-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srfbp1Q9CZ91 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Srfbp1Q9CZ91 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Srfbp1Q9CZ91 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Srfbp1Q9CZ91 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Srfbp1Q9CZ91 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Srfbp1Q9CZ91 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Srfbp1Q9CZ91 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Srfbp1Q9CZ91 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Srfbp1Q9CZ91 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Srfbp1Q9CZ91 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Srfbp1Q9CZ91 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Srfbp1Q9CZ91 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Srfbp1Q9CZ91 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Srfbp1Q9CZ91 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srfbp1Q9CZ91 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Srfbp1Q9CZ91 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Srfbp1Q9CZ91 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Srfbp1Q9CZ91 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srfbp1Q9CZ91 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Srfbp1Q9CZ91 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Srfbp1Q9CZ91 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srfbp1Q9CZ91 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Srfbp1Q9CZ91 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srfbp1Q9CZ91 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srfbp1Q9CZ91 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srfbp1Q9CZ91 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Srfbp1Q9CZ91 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Srfbp1Q9CZ91 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srfbp1Q9CZ91 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srfbp1Q9CZ91 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srfbp1Q9CZ91 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srfbp1Q9CZ91 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srfbp1Q9CZ91 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srfbp1Q9CZ91 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srfbp1Q9CZ91 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srfbp1Q9CZ91 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srfbp1Q9CZ91 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srfbp1Q9CZ91 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srfbp1Q9CZ91 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Srfbp1Q9CZ91 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srfbp1Q9CZ91 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srfbp1Q9CZ91 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srfbp1Q9CZ91 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Srfbp1Q9CZ91 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srfbp1Q9CZ91 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srfbp1Q9CZ91 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srfbp1Q9CZ91 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srfbp1Q9CZ91 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srfbp1Q9CZ91 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srfbp1Q9CZ91 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Srfbp1Q9CZ91 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Srfbp1Q9CZ91 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Srfbp1Q9CZ91 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Srfbp1Q9CZ91 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srfbp1Q9CZ91 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Srfbp1Q9CZ91 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srfbp1Q9CZ91 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Srfbp1Q9CZ91 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Srfbp1Q9CZ91 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Srfbp1Q9CZ91 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Srfbp1Q9CZ91 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Srfbp1Q9CZ91 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Srfbp1Q9CZ91 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Srfbp1Q9CZ91 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Srfbp1Q9CZ91 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Srfbp1Q9CZ91 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srfbp1Q9CZ91 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srfbp1Q9CZ91 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Srfbp1Q9CZ91 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Srfbp1Q9CZ91 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Srfbp1Q9CZ91 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Srfbp1Q9CZ91 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Srfbp1Q9CZ91 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srfbp1Q9CZ91 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srfbp1Q9CZ91 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srfbp1Q9CZ91 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srfbp1Q9CZ91 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srfbp1Q9CZ91 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srfbp1Q9CZ91 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srfbp1Q9CZ91 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srfbp1Q9CZ91 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srfbp1Q9CZ91 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srfbp1Q9CZ91 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srfbp1Q9CZ91 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srfbp1Q9CZ91 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srfbp1Q9CZ91 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srfbp1Q9CZ91 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srfbp1Q9CZ91 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Srfbp1Q9CZ91 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Srfbp1Q9CZ91 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srfbp1Q9CZ91 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srfbp1Q9CZ91 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srfbp1Q9CZ91 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Srfbp1Q9CZ91 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srfbp1Q9CZ91 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Srfbp1Q9CZ91 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srfbp1Q9CZ91 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srfbp1Q9CZ91 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Srfbp1Q9CZ91 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srfbp1Q9CZ91 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms