Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
3110001I22RikQ9CZ70 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
3110001I22RikQ9CZ70 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
3110001I22RikQ9CZ70 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
3110001I22RikQ9CZ70 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
3110001I22RikQ9CZ70 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
3110001I22RikQ9CZ70 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
3110001I22RikQ9CZ70 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
3110001I22RikQ9CZ70 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
3110001I22RikQ9CZ70 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
3110001I22RikQ9CZ70 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
3110001I22RikQ9CZ70 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
3110001I22RikQ9CZ70 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
3110001I22RikQ9CZ70 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
3110001I22RikQ9CZ70 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
3110001I22RikQ9CZ70 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
3110001I22RikQ9CZ70 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
3110001I22RikQ9CZ70 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
3110001I22RikQ9CZ70 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
3110001I22RikQ9CZ70 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
3110001I22RikQ9CZ70 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
3110001I22RikQ9CZ70 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
3110001I22RikQ9CZ70 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
3110001I22RikQ9CZ70 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
3110001I22RikQ9CZ70 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
3110001I22RikQ9CZ70 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
3110001I22RikQ9CZ70 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
3110001I22RikQ9CZ70 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
3110001I22RikQ9CZ70 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
3110001I22RikQ9CZ70 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
3110001I22RikQ9CZ70 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
3110001I22RikQ9CZ70 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
3110001I22RikQ9CZ70 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
3110001I22RikQ9CZ70 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
3110001I22RikQ9CZ70 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
3110001I22RikQ9CZ70 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
3110001I22RikQ9CZ70 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
3110001I22RikQ9CZ70 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
3110001I22RikQ9CZ70 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
3110001I22RikQ9CZ70 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
3110001I22RikQ9CZ70 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
3110001I22RikQ9CZ70 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
3110001I22RikQ9CZ70 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
3110001I22RikQ9CZ70 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
3110001I22RikQ9CZ70 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
3110001I22RikQ9CZ70 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
3110001I22RikQ9CZ70 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
3110001I22RikQ9CZ70 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
3110001I22RikQ9CZ70 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
3110001I22RikQ9CZ70 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
3110001I22RikQ9CZ70 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
3110001I22RikQ9CZ70 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
3110001I22RikQ9CZ70 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
3110001I22RikQ9CZ70 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
3110001I22RikQ9CZ70 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
3110001I22RikQ9CZ70 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
3110001I22RikQ9CZ70 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
3110001I22RikQ9CZ70 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
3110001I22RikQ9CZ70 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
3110001I22RikQ9CZ70 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
3110001I22RikQ9CZ70 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
3110001I22RikQ9CZ70 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
3110001I22RikQ9CZ70 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
3110001I22RikQ9CZ70 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
3110001I22RikQ9CZ70 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
3110001I22RikQ9CZ70 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
3110001I22RikQ9CZ70 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
3110001I22RikQ9CZ70 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
3110001I22RikQ9CZ70 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
3110001I22RikQ9CZ70 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
3110001I22RikQ9CZ70 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
3110001I22RikQ9CZ70 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
3110001I22RikQ9CZ70 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
3110001I22RikQ9CZ70 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
3110001I22RikQ9CZ70 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
3110001I22RikQ9CZ70 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
3110001I22RikQ9CZ70 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
3110001I22RikQ9CZ70 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
3110001I22RikQ9CZ70 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
3110001I22RikQ9CZ70 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
3110001I22RikQ9CZ70 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
3110001I22RikQ9CZ70 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
3110001I22RikQ9CZ70 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
3110001I22RikQ9CZ70 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
3110001I22RikQ9CZ70 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
3110001I22RikQ9CZ70 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
3110001I22RikQ9CZ70 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
3110001I22RikQ9CZ70 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
3110001I22RikQ9CZ70 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
3110001I22RikQ9CZ70 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
3110001I22RikQ9CZ70 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
3110001I22RikQ9CZ70 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
3110001I22RikQ9CZ70 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
3110001I22RikQ9CZ70 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
3110001I22RikQ9CZ70 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
3110001I22RikQ9CZ70 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
3110001I22RikQ9CZ70 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms