Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rprd1bQ9CSU0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rprd1bQ9CSU0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rprd1bQ9CSU0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rprd1bQ9CSU0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rprd1bQ9CSU0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rprd1bQ9CSU0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rprd1bQ9CSU0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rprd1bQ9CSU0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rprd1bQ9CSU0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rprd1bQ9CSU0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rprd1bQ9CSU0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rprd1bQ9CSU0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rprd1bQ9CSU0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rprd1bQ9CSU0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rprd1bQ9CSU0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rprd1bQ9CSU0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rprd1bQ9CSU0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rprd1bQ9CSU0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rprd1bQ9CSU0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rprd1bQ9CSU0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rprd1bQ9CSU0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rprd1bQ9CSU0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rprd1bQ9CSU0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rprd1bQ9CSU0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rprd1bQ9CSU0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rprd1bQ9CSU0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rprd1bQ9CSU0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rprd1bQ9CSU0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rprd1bQ9CSU0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rprd1bQ9CSU0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rprd1bQ9CSU0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rprd1bQ9CSU0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rprd1bQ9CSU0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd1bQ9CSU0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd1bQ9CSU0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rprd1bQ9CSU0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rprd1bQ9CSU0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rprd1bQ9CSU0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd1bQ9CSU0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd1bQ9CSU0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rprd1bQ9CSU0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rprd1bQ9CSU0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rprd1bQ9CSU0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rprd1bQ9CSU0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd1bQ9CSU0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rprd1bQ9CSU0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rprd1bQ9CSU0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rprd1bQ9CSU0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rprd1bQ9CSU0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rprd1bQ9CSU0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rprd1bQ9CSU0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rprd1bQ9CSU0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rprd1bQ9CSU0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rprd1bQ9CSU0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rprd1bQ9CSU0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rprd1bQ9CSU0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rprd1bQ9CSU0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rprd1bQ9CSU0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rprd1bQ9CSU0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd1bQ9CSU0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rprd1bQ9CSU0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rprd1bQ9CSU0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rprd1bQ9CSU0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rprd1bQ9CSU0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rprd1bQ9CSU0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rprd1bQ9CSU0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rprd1bQ9CSU0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rprd1bQ9CSU0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rprd1bQ9CSU0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rprd1bQ9CSU0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rprd1bQ9CSU0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rprd1bQ9CSU0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rprd1bQ9CSU0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rprd1bQ9CSU0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rprd1bQ9CSU0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rprd1bQ9CSU0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rprd1bQ9CSU0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd1bQ9CSU0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd1bQ9CSU0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd1bQ9CSU0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd1bQ9CSU0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd1bQ9CSU0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd1bQ9CSU0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rprd1bQ9CSU0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd1bQ9CSU0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd1bQ9CSU0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd1bQ9CSU0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd1bQ9CSU0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rprd1bQ9CSU0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rprd1bQ9CSU0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rprd1bQ9CSU0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms