Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itgb3bpQ9CQ82 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itgb3bpQ9CQ82 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itgb3bpQ9CQ82 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itgb3bpQ9CQ82 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Itgb3bpQ9CQ82 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itgb3bpQ9CQ82 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb3bpQ9CQ82 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Itgb3bpQ9CQ82 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itgb3bpQ9CQ82 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb3bpQ9CQ82 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itgb3bpQ9CQ82 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb3bpQ9CQ82 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itgb3bpQ9CQ82 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itgb3bpQ9CQ82 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itgb3bpQ9CQ82 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb3bpQ9CQ82 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb3bpQ9CQ82 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb3bpQ9CQ82 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb3bpQ9CQ82 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb3bpQ9CQ82 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb3bpQ9CQ82 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb3bpQ9CQ82 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb3bpQ9CQ82 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itgb3bpQ9CQ82 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb3bpQ9CQ82 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itgb3bpQ9CQ82 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itgb3bpQ9CQ82 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itgb3bpQ9CQ82 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itgb3bpQ9CQ82 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itgb3bpQ9CQ82 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itgb3bpQ9CQ82 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itgb3bpQ9CQ82 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itgb3bpQ9CQ82 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itgb3bpQ9CQ82 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itgb3bpQ9CQ82 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itgb3bpQ9CQ82 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb3bpQ9CQ82 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb3bpQ9CQ82 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itgb3bpQ9CQ82 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itgb3bpQ9CQ82 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Itgb3bpQ9CQ82 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb3bpQ9CQ82 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb3bpQ9CQ82 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb3bpQ9CQ82 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb3bpQ9CQ82 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb3bpQ9CQ82 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb3bpQ9CQ82 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb3bpQ9CQ82 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb3bpQ9CQ82 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb3bpQ9CQ82 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb3bpQ9CQ82 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb3bpQ9CQ82 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb3bpQ9CQ82 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb3bpQ9CQ82 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb3bpQ9CQ82 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb3bpQ9CQ82 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb3bpQ9CQ82 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb3bpQ9CQ82 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb3bpQ9CQ82 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb3bpQ9CQ82 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb3bpQ9CQ82 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb3bpQ9CQ82 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb3bpQ9CQ82 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itgb3bpQ9CQ82 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb3bpQ9CQ82 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb3bpQ9CQ82 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itgb3bpQ9CQ82 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb3bpQ9CQ82 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb3bpQ9CQ82 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb3bpQ9CQ82 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb3bpQ9CQ82 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb3bpQ9CQ82 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb3bpQ9CQ82 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb3bpQ9CQ82 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb3bpQ9CQ82 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb3bpQ9CQ82 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itgb3bpQ9CQ82 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb3bpQ9CQ82 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb3bpQ9CQ82 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itgb3bpQ9CQ82 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb3bpQ9CQ82 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb3bpQ9CQ82 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb3bpQ9CQ82 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb3bpQ9CQ82 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb3bpQ9CQ82 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb3bpQ9CQ82 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb3bpQ9CQ82 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Itgb3bpQ9CQ82 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb3bpQ9CQ82 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb3bpQ9CQ82 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms