Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mid1ip1Q9CQ20 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mid1ip1Q9CQ20 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mid1ip1Q9CQ20 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mid1ip1Q9CQ20 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mid1ip1Q9CQ20 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mid1ip1Q9CQ20 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mid1ip1Q9CQ20 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mid1ip1Q9CQ20 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mid1ip1Q9CQ20 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mid1ip1Q9CQ20 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mid1ip1Q9CQ20 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mid1ip1Q9CQ20 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mid1ip1Q9CQ20 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mid1ip1Q9CQ20 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mid1ip1Q9CQ20 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mid1ip1Q9CQ20 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mid1ip1Q9CQ20 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mid1ip1Q9CQ20 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mid1ip1Q9CQ20 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mid1ip1Q9CQ20 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mid1ip1Q9CQ20 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mid1ip1Q9CQ20 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mid1ip1Q9CQ20 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mid1ip1Q9CQ20 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mid1ip1Q9CQ20 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mid1ip1Q9CQ20 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mid1ip1Q9CQ20 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mid1ip1Q9CQ20 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mid1ip1Q9CQ20 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mid1ip1Q9CQ20 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mid1ip1Q9CQ20 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mid1ip1Q9CQ20 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Mid1ip1Q9CQ20 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mid1ip1Q9CQ20 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mid1ip1Q9CQ20 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mid1ip1Q9CQ20 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mid1ip1Q9CQ20 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mid1ip1Q9CQ20 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mid1ip1Q9CQ20 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mid1ip1Q9CQ20 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Mid1ip1Q9CQ20 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mid1ip1Q9CQ20 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mid1ip1Q9CQ20 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mid1ip1Q9CQ20 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mid1ip1Q9CQ20 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mid1ip1Q9CQ20 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mid1ip1Q9CQ20 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Mid1ip1Q9CQ20 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mid1ip1Q9CQ20 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mid1ip1Q9CQ20 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mid1ip1Q9CQ20 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mid1ip1Q9CQ20 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mid1ip1Q9CQ20 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mid1ip1Q9CQ20 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mid1ip1Q9CQ20 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mid1ip1Q9CQ20 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mid1ip1Q9CQ20 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mid1ip1Q9CQ20 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mid1ip1Q9CQ20 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mid1ip1Q9CQ20 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mid1ip1Q9CQ20 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mid1ip1Q9CQ20 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mid1ip1Q9CQ20 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mid1ip1Q9CQ20 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mid1ip1Q9CQ20 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mid1ip1Q9CQ20 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mid1ip1Q9CQ20 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mid1ip1Q9CQ20 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mid1ip1Q9CQ20 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mid1ip1Q9CQ20 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mid1ip1Q9CQ20 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mid1ip1Q9CQ20 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mid1ip1Q9CQ20 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mid1ip1Q9CQ20 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mid1ip1Q9CQ20 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mid1ip1Q9CQ20 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mid1ip1Q9CQ20 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mid1ip1Q9CQ20 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mid1ip1Q9CQ20 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mid1ip1Q9CQ20 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mid1ip1Q9CQ20 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mid1ip1Q9CQ20 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mid1ip1Q9CQ20 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mid1ip1Q9CQ20 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mid1ip1Q9CQ20 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mid1ip1Q9CQ20 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mid1ip1Q9CQ20 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mid1ip1Q9CQ20 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mid1ip1Q9CQ20 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mid1ip1Q9CQ20 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mid1ip1Q9CQ20 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mid1ip1Q9CQ20 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms