Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnaseh2cQ9CQ18 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnaseh2cQ9CQ18 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnaseh2cQ9CQ18 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnaseh2cQ9CQ18 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnaseh2cQ9CQ18 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnaseh2cQ9CQ18 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnaseh2cQ9CQ18 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnaseh2cQ9CQ18 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnaseh2cQ9CQ18 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnaseh2cQ9CQ18 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnaseh2cQ9CQ18 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Rnaseh2cQ9CQ18 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnaseh2cQ9CQ18 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnaseh2cQ9CQ18 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnaseh2cQ9CQ18 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnaseh2cQ9CQ18 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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