Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
4930519G04RikQ9CPT7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
4930519G04RikQ9CPT7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
4930519G04RikQ9CPT7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
4930519G04RikQ9CPT7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4930519G04RikQ9CPT7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930519G04RikQ9CPT7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
4930519G04RikQ9CPT7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
4930519G04RikQ9CPT7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4930519G04RikQ9CPT7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930519G04RikQ9CPT7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
4930519G04RikQ9CPT7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
4930519G04RikQ9CPT7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
4930519G04RikQ9CPT7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
4930519G04RikQ9CPT7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
4930519G04RikQ9CPT7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
4930519G04RikQ9CPT7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
4930519G04RikQ9CPT7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
4930519G04RikQ9CPT7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
4930519G04RikQ9CPT7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4930519G04RikQ9CPT7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4930519G04RikQ9CPT7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
4930519G04RikQ9CPT7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
4930519G04RikQ9CPT7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930519G04RikQ9CPT7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930519G04RikQ9CPT7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930519G04RikQ9CPT7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
4930519G04RikQ9CPT7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930519G04RikQ9CPT7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930519G04RikQ9CPT7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930519G04RikQ9CPT7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
4930519G04RikQ9CPT7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4930519G04RikQ9CPT7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
4930519G04RikQ9CPT7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
4930519G04RikQ9CPT7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
4930519G04RikQ9CPT7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
4930519G04RikQ9CPT7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
4930519G04RikQ9CPT7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
4930519G04RikQ9CPT7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
4930519G04RikQ9CPT7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
4930519G04RikQ9CPT7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
4930519G04RikQ9CPT7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
4930519G04RikQ9CPT7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
4930519G04RikQ9CPT7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
4930519G04RikQ9CPT7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
4930519G04RikQ9CPT7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
4930519G04RikQ9CPT7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930519G04RikQ9CPT7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
4930519G04RikQ9CPT7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
4930519G04RikQ9CPT7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930519G04RikQ9CPT7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930519G04RikQ9CPT7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930519G04RikQ9CPT7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930519G04RikQ9CPT7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930519G04RikQ9CPT7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930519G04RikQ9CPT7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930519G04RikQ9CPT7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930519G04RikQ9CPT7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930519G04RikQ9CPT7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930519G04RikQ9CPT7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
4930519G04RikQ9CPT7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
4930519G04RikQ9CPT7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930519G04RikQ9CPT7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
4930519G04RikQ9CPT7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
4930519G04RikQ9CPT7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
4930519G04RikQ9CPT7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
4930519G04RikQ9CPT7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
4930519G04RikQ9CPT7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930519G04RikQ9CPT7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
4930519G04RikQ9CPT7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930519G04RikQ9CPT7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930519G04RikQ9CPT7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930519G04RikQ9CPT7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930519G04RikQ9CPT7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930519G04RikQ9CPT7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930519G04RikQ9CPT7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
4930519G04RikQ9CPT7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930519G04RikQ9CPT7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930519G04RikQ9CPT7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930519G04RikQ9CPT7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930519G04RikQ9CPT7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930519G04RikQ9CPT7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930519G04RikQ9CPT7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930519G04RikQ9CPT7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930519G04RikQ9CPT7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930519G04RikQ9CPT7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
4930519G04RikQ9CPT7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930519G04RikQ9CPT7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930519G04RikQ9CPT7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
4930519G04RikQ9CPT7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930519G04RikQ9CPT7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930519G04RikQ9CPT7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930519G04RikQ9CPT7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930519G04RikQ9CPT7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930519G04RikQ9CPT7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930519G04RikQ9CPT7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
4930519G04RikQ9CPT7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms