Protein–RNA interactions for Protein: Q99PD7

Slc24a3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc24a3Q99PD7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc24a3Q99PD7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc24a3Q99PD7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc24a3Q99PD7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc24a3Q99PD7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc24a3Q99PD7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc24a3Q99PD7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc24a3Q99PD7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc24a3Q99PD7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc24a3Q99PD7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc24a3Q99PD7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc24a3Q99PD7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc24a3Q99PD7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc24a3Q99PD7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc24a3Q99PD7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc24a3Q99PD7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc24a3Q99PD7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc24a3Q99PD7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc24a3Q99PD7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc24a3Q99PD7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc24a3Q99PD7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc24a3Q99PD7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc24a3Q99PD7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc24a3Q99PD7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc24a3Q99PD7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc24a3Q99PD7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc24a3Q99PD7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc24a3Q99PD7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc24a3Q99PD7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc24a3Q99PD7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc24a3Q99PD7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc24a3Q99PD7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc24a3Q99PD7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc24a3Q99PD7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc24a3Q99PD7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc24a3Q99PD7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc24a3Q99PD7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc24a3Q99PD7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc24a3Q99PD7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc24a3Q99PD7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc24a3Q99PD7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc24a3Q99PD7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc24a3Q99PD7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc24a3Q99PD7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc24a3Q99PD7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc24a3Q99PD7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc24a3Q99PD7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc24a3Q99PD7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc24a3Q99PD7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc24a3Q99PD7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc24a3Q99PD7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc24a3Q99PD7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc24a3Q99PD7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc24a3Q99PD7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc24a3Q99PD7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc24a3Q99PD7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc24a3Q99PD7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc24a3Q99PD7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc24a3Q99PD7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc24a3Q99PD7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc24a3Q99PD7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc24a3Q99PD7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc24a3Q99PD7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc24a3Q99PD7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc24a3Q99PD7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc24a3Q99PD7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc24a3Q99PD7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc24a3Q99PD7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc24a3Q99PD7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc24a3Q99PD7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc24a3Q99PD7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc24a3Q99PD7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc24a3Q99PD7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc24a3Q99PD7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc24a3Q99PD7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc24a3Q99PD7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc24a3Q99PD7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc24a3Q99PD7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc24a3Q99PD7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc24a3Q99PD7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc24a3Q99PD7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc24a3Q99PD7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc24a3Q99PD7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc24a3Q99PD7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc24a3Q99PD7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc24a3Q99PD7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc24a3Q99PD7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc24a3Q99PD7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc24a3Q99PD7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc24a3Q99PD7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc24a3Q99PD7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc24a3Q99PD7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc24a3Q99PD7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc24a3Q99PD7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc24a3Q99PD7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc24a3Q99PD7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc24a3Q99PD7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc24a3Q99PD7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc24a3Q99PD7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc24a3Q99PD7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms