Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930550L24RikQ99PA7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930550L24RikQ99PA7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
4930550L24RikQ99PA7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
4930550L24RikQ99PA7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
4930550L24RikQ99PA7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
4930550L24RikQ99PA7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
4930550L24RikQ99PA7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
4930550L24RikQ99PA7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
4930550L24RikQ99PA7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
4930550L24RikQ99PA7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
4930550L24RikQ99PA7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
4930550L24RikQ99PA7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
4930550L24RikQ99PA7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
4930550L24RikQ99PA7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
4930550L24RikQ99PA7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
4930550L24RikQ99PA7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
4930550L24RikQ99PA7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930550L24RikQ99PA7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
4930550L24RikQ99PA7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
4930550L24RikQ99PA7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
4930550L24RikQ99PA7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930550L24RikQ99PA7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930550L24RikQ99PA7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
4930550L24RikQ99PA7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
4930550L24RikQ99PA7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930550L24RikQ99PA7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
4930550L24RikQ99PA7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
4930550L24RikQ99PA7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
4930550L24RikQ99PA7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
4930550L24RikQ99PA7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
4930550L24RikQ99PA7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
4930550L24RikQ99PA7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4930550L24RikQ99PA7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4930550L24RikQ99PA7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
4930550L24RikQ99PA7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
4930550L24RikQ99PA7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
4930550L24RikQ99PA7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
4930550L24RikQ99PA7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
4930550L24RikQ99PA7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
4930550L24RikQ99PA7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
4930550L24RikQ99PA7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
4930550L24RikQ99PA7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
4930550L24RikQ99PA7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
4930550L24RikQ99PA7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
4930550L24RikQ99PA7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
4930550L24RikQ99PA7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
4930550L24RikQ99PA7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
4930550L24RikQ99PA7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
4930550L24RikQ99PA7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
4930550L24RikQ99PA7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
4930550L24RikQ99PA7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
4930550L24RikQ99PA7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
4930550L24RikQ99PA7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
4930550L24RikQ99PA7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
4930550L24RikQ99PA7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
4930550L24RikQ99PA7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
4930550L24RikQ99PA7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
4930550L24RikQ99PA7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4930550L24RikQ99PA7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
4930550L24RikQ99PA7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4930550L24RikQ99PA7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4930550L24RikQ99PA7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
4930550L24RikQ99PA7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
4930550L24RikQ99PA7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4930550L24RikQ99PA7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930550L24RikQ99PA7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
4930550L24RikQ99PA7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930550L24RikQ99PA7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4930550L24RikQ99PA7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
4930550L24RikQ99PA7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
4930550L24RikQ99PA7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
4930550L24RikQ99PA7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
4930550L24RikQ99PA7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
4930550L24RikQ99PA7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
4930550L24RikQ99PA7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
4930550L24RikQ99PA7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
4930550L24RikQ99PA7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
4930550L24RikQ99PA7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
4930550L24RikQ99PA7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
4930550L24RikQ99PA7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
4930550L24RikQ99PA7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
4930550L24RikQ99PA7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
4930550L24RikQ99PA7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
4930550L24RikQ99PA7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930550L24RikQ99PA7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
4930550L24RikQ99PA7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
4930550L24RikQ99PA7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
4930550L24RikQ99PA7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
4930550L24RikQ99PA7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4930550L24RikQ99PA7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4930550L24RikQ99PA7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
4930550L24RikQ99PA7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930550L24RikQ99PA7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930550L24RikQ99PA7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4930550L24RikQ99PA7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4930550L24RikQ99PA7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
4930550L24RikQ99PA7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
4930550L24RikQ99PA7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
4930550L24RikQ99PA7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms