Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RetnQ99P87 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RetnQ99P87 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RetnQ99P87 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RetnQ99P87 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RetnQ99P87 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RetnQ99P87 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RetnQ99P87 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RetnQ99P87 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RetnQ99P87 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RetnQ99P87 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RetnQ99P87 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RetnQ99P87 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RetnQ99P87 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RetnQ99P87 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RetnQ99P87 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RetnQ99P87 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RetnQ99P87 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RetnQ99P87 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RetnQ99P87 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RetnQ99P87 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RetnQ99P87 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RetnQ99P87 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RetnQ99P87 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RetnQ99P87 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RetnQ99P87 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RetnQ99P87 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RetnQ99P87 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RetnQ99P87 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RetnQ99P87 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RetnQ99P87 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RetnQ99P87 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RetnQ99P87 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RetnQ99P87 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RetnQ99P87 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RetnQ99P87 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RetnQ99P87 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RetnQ99P87 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RetnQ99P87 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RetnQ99P87 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RetnQ99P87 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RetnQ99P87 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RetnQ99P87 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RetnQ99P87 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RetnQ99P87 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RetnQ99P87 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RetnQ99P87 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RetnQ99P87 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RetnQ99P87 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RetnQ99P87 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RetnQ99P87 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RetnQ99P87 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RetnQ99P87 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RetnQ99P87 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RetnQ99P87 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RetnQ99P87 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RetnQ99P87 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RetnQ99P87 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RetnQ99P87 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RetnQ99P87 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RetnQ99P87 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RetnQ99P87 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RetnQ99P87 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RetnQ99P87 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RetnQ99P87 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RetnQ99P87 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RetnQ99P87 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RetnQ99P87 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RetnQ99P87 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RetnQ99P87 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RetnQ99P87 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RetnQ99P87 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RetnQ99P87 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RetnQ99P87 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RetnQ99P87 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RetnQ99P87 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RetnQ99P87 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RetnQ99P87 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RetnQ99P87 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RetnQ99P87 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RetnQ99P87 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RetnQ99P87 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RetnQ99P87 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RetnQ99P87 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RetnQ99P87 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RetnQ99P87 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RetnQ99P87 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RetnQ99P87 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RetnQ99P87 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RetnQ99P87 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RetnQ99P87 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RetnQ99P87 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RetnQ99P87 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RetnQ99P87 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RetnQ99P87 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RetnQ99P87 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RetnQ99P87 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RetnQ99P87 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RetnQ99P87 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RetnQ99P87 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms