Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB5

Gsdmc, Gasdermin-C, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmcQ99NB5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GsdmcQ99NB5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GsdmcQ99NB5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GsdmcQ99NB5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GsdmcQ99NB5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GsdmcQ99NB5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GsdmcQ99NB5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GsdmcQ99NB5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GsdmcQ99NB5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GsdmcQ99NB5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GsdmcQ99NB5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GsdmcQ99NB5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GsdmcQ99NB5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GsdmcQ99NB5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GsdmcQ99NB5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GsdmcQ99NB5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GsdmcQ99NB5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GsdmcQ99NB5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GsdmcQ99NB5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GsdmcQ99NB5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GsdmcQ99NB5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GsdmcQ99NB5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GsdmcQ99NB5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GsdmcQ99NB5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GsdmcQ99NB5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GsdmcQ99NB5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GsdmcQ99NB5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GsdmcQ99NB5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GsdmcQ99NB5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GsdmcQ99NB5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GsdmcQ99NB5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GsdmcQ99NB5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GsdmcQ99NB5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GsdmcQ99NB5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GsdmcQ99NB5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GsdmcQ99NB5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GsdmcQ99NB5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GsdmcQ99NB5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GsdmcQ99NB5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GsdmcQ99NB5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GsdmcQ99NB5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GsdmcQ99NB5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GsdmcQ99NB5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GsdmcQ99NB5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GsdmcQ99NB5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GsdmcQ99NB5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GsdmcQ99NB5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GsdmcQ99NB5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GsdmcQ99NB5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GsdmcQ99NB5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GsdmcQ99NB5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GsdmcQ99NB5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GsdmcQ99NB5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GsdmcQ99NB5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GsdmcQ99NB5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GsdmcQ99NB5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GsdmcQ99NB5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GsdmcQ99NB5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GsdmcQ99NB5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GsdmcQ99NB5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GsdmcQ99NB5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GsdmcQ99NB5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GsdmcQ99NB5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GsdmcQ99NB5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GsdmcQ99NB5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GsdmcQ99NB5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GsdmcQ99NB5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GsdmcQ99NB5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GsdmcQ99NB5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GsdmcQ99NB5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GsdmcQ99NB5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GsdmcQ99NB5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GsdmcQ99NB5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GsdmcQ99NB5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GsdmcQ99NB5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GsdmcQ99NB5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GsdmcQ99NB5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GsdmcQ99NB5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GsdmcQ99NB5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GsdmcQ99NB5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GsdmcQ99NB5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GsdmcQ99NB5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GsdmcQ99NB5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GsdmcQ99NB5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GsdmcQ99NB5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GsdmcQ99NB5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GsdmcQ99NB5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GsdmcQ99NB5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GsdmcQ99NB5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GsdmcQ99NB5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GsdmcQ99NB5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GsdmcQ99NB5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GsdmcQ99NB5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GsdmcQ99NB5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GsdmcQ99NB5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GsdmcQ99NB5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GsdmcQ99NB5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GsdmcQ99NB5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GsdmcQ99NB5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GsdmcQ99NB5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms