Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdca3Q99M54 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdca3Q99M54 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdca3Q99M54 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdca3Q99M54 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdca3Q99M54 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdca3Q99M54 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdca3Q99M54 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdca3Q99M54 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdca3Q99M54 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdca3Q99M54 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdca3Q99M54 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdca3Q99M54 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdca3Q99M54 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdca3Q99M54 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdca3Q99M54 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdca3Q99M54 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdca3Q99M54 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdca3Q99M54 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdca3Q99M54 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdca3Q99M54 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdca3Q99M54 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdca3Q99M54 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdca3Q99M54 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdca3Q99M54 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdca3Q99M54 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdca3Q99M54 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdca3Q99M54 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdca3Q99M54 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdca3Q99M54 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdca3Q99M54 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdca3Q99M54 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdca3Q99M54 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdca3Q99M54 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdca3Q99M54 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdca3Q99M54 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdca3Q99M54 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdca3Q99M54 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdca3Q99M54 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdca3Q99M54 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdca3Q99M54 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdca3Q99M54 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdca3Q99M54 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdca3Q99M54 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdca3Q99M54 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdca3Q99M54 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdca3Q99M54 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdca3Q99M54 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdca3Q99M54 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdca3Q99M54 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdca3Q99M54 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdca3Q99M54 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdca3Q99M54 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdca3Q99M54 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdca3Q99M54 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdca3Q99M54 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdca3Q99M54 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdca3Q99M54 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdca3Q99M54 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdca3Q99M54 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdca3Q99M54 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdca3Q99M54 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdca3Q99M54 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdca3Q99M54 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdca3Q99M54 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdca3Q99M54 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdca3Q99M54 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdca3Q99M54 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdca3Q99M54 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdca3Q99M54 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdca3Q99M54 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdca3Q99M54 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdca3Q99M54 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdca3Q99M54 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdca3Q99M54 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdca3Q99M54 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdca3Q99M54 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdca3Q99M54 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdca3Q99M54 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdca3Q99M54 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdca3Q99M54 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdca3Q99M54 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdca3Q99M54 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdca3Q99M54 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdca3Q99M54 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdca3Q99M54 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdca3Q99M54 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdca3Q99M54 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdca3Q99M54 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdca3Q99M54 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdca3Q99M54 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdca3Q99M54 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdca3Q99M54 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdca3Q99M54 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdca3Q99M54 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdca3Q99M54 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdca3Q99M54 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdca3Q99M54 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdca3Q99M54 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdca3Q99M54 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms