Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cdk9Q99J95 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk9Q99J95 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk9Q99J95 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk9Q99J95 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk9Q99J95 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk9Q99J95 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk9Q99J95 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk9Q99J95 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk9Q99J95 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk9Q99J95 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk9Q99J95 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk9Q99J95 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk9Q99J95 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk9Q99J95 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk9Q99J95 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk9Q99J95 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk9Q99J95 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk9Q99J95 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk9Q99J95 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk9Q99J95 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk9Q99J95 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk9Q99J95 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk9Q99J95 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdk9Q99J95 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk9Q99J95 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk9Q99J95 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk9Q99J95 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk9Q99J95 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk9Q99J95 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk9Q99J95 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk9Q99J95 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk9Q99J95 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk9Q99J95 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk9Q99J95 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk9Q99J95 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk9Q99J95 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdk9Q99J95 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdk9Q99J95 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdk9Q99J95 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk9Q99J95 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk9Q99J95 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk9Q99J95 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk9Q99J95 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk9Q99J95 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cdk9Q99J95 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk9Q99J95 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk9Q99J95 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk9Q99J95 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk9Q99J95 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk9Q99J95 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk9Q99J95 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk9Q99J95 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk9Q99J95 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk9Q99J95 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk9Q99J95 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk9Q99J95 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk9Q99J95 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk9Q99J95 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk9Q99J95 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk9Q99J95 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cdk9Q99J95 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk9Q99J95 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdk9Q99J95 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdk9Q99J95 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdk9Q99J95 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdk9Q99J95 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdk9Q99J95 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdk9Q99J95 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdk9Q99J95 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk9Q99J95 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk9Q99J95 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk9Q99J95 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdk9Q99J95 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk9Q99J95 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk9Q99J95 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk9Q99J95 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk9Q99J95 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk9Q99J95 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk9Q99J95 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk9Q99J95 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdk9Q99J95 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk9Q99J95 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk9Q99J95 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk9Q99J95 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk9Q99J95 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk9Q99J95 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdk9Q99J95 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk9Q99J95 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdk9Q99J95 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdk9Q99J95 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk9Q99J95 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk9Q99J95 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk9Q99J95 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk9Q99J95 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk9Q99J95 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdk9Q99J95 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cdk9Q99J95 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk9Q99J95 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk9Q99J95 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms