Protein–RNA interactions for Protein: Q99J87

Dhx58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx58Q99J87 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dhx58Q99J87 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dhx58Q99J87 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dhx58Q99J87 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dhx58Q99J87 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Dhx58Q99J87 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dhx58Q99J87 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dhx58Q99J87 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dhx58Q99J87 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Dhx58Q99J87 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dhx58Q99J87 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dhx58Q99J87 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dhx58Q99J87 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dhx58Q99J87 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dhx58Q99J87 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dhx58Q99J87 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dhx58Q99J87 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dhx58Q99J87 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dhx58Q99J87 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dhx58Q99J87 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dhx58Q99J87 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dhx58Q99J87 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Dhx58Q99J87 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Dhx58Q99J87 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Dhx58Q99J87 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Dhx58Q99J87 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dhx58Q99J87 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dhx58Q99J87 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dhx58Q99J87 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dhx58Q99J87 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dhx58Q99J87 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dhx58Q99J87 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dhx58Q99J87 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dhx58Q99J87 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dhx58Q99J87 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dhx58Q99J87 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dhx58Q99J87 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx58Q99J87 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx58Q99J87 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dhx58Q99J87 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Dhx58Q99J87 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dhx58Q99J87 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dhx58Q99J87 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dhx58Q99J87 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Dhx58Q99J87 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Dhx58Q99J87 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dhx58Q99J87 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dhx58Q99J87 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Dhx58Q99J87 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Dhx58Q99J87 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Dhx58Q99J87 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Dhx58Q99J87 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Dhx58Q99J87 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dhx58Q99J87 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dhx58Q99J87 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dhx58Q99J87 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dhx58Q99J87 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Dhx58Q99J87 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dhx58Q99J87 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dhx58Q99J87 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dhx58Q99J87 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Dhx58Q99J87 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Dhx58Q99J87 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Dhx58Q99J87 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dhx58Q99J87 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dhx58Q99J87 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dhx58Q99J87 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dhx58Q99J87 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dhx58Q99J87 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Dhx58Q99J87 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Dhx58Q99J87 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Dhx58Q99J87 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Dhx58Q99J87 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Dhx58Q99J87 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Dhx58Q99J87 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Dhx58Q99J87 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dhx58Q99J87 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Dhx58Q99J87 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dhx58Q99J87 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dhx58Q99J87 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Dhx58Q99J87 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dhx58Q99J87 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dhx58Q99J87 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dhx58Q99J87 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dhx58Q99J87 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dhx58Q99J87 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dhx58Q99J87 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dhx58Q99J87 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dhx58Q99J87 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dhx58Q99J87 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dhx58Q99J87 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dhx58Q99J87 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dhx58Q99J87 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dhx58Q99J87 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dhx58Q99J87 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dhx58Q99J87 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dhx58Q99J87 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Dhx58Q99J87 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dhx58Q99J87 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dhx58Q99J87 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms