Protein–RNA interactions for Protein: Q921I9

Exosc4, Exosome complex component RRP41, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc4Q921I9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc4Q921I9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc4Q921I9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Exosc4Q921I9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Exosc4Q921I9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Exosc4Q921I9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Exosc4Q921I9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Exosc4Q921I9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Exosc4Q921I9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc4Q921I9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Exosc4Q921I9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Exosc4Q921I9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Exosc4Q921I9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Exosc4Q921I9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Exosc4Q921I9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Exosc4Q921I9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Exosc4Q921I9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Exosc4Q921I9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Exosc4Q921I9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Exosc4Q921I9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Exosc4Q921I9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Exosc4Q921I9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Exosc4Q921I9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Exosc4Q921I9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Exosc4Q921I9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Exosc4Q921I9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Exosc4Q921I9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Exosc4Q921I9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Exosc4Q921I9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Exosc4Q921I9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Exosc4Q921I9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Exosc4Q921I9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Exosc4Q921I9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Exosc4Q921I9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Exosc4Q921I9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Exosc4Q921I9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Exosc4Q921I9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Exosc4Q921I9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Exosc4Q921I9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Exosc4Q921I9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Exosc4Q921I9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Exosc4Q921I9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Exosc4Q921I9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Exosc4Q921I9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Exosc4Q921I9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Exosc4Q921I9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Exosc4Q921I9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Exosc4Q921I9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Exosc4Q921I9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Exosc4Q921I9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Exosc4Q921I9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Exosc4Q921I9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Exosc4Q921I9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Exosc4Q921I9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Exosc4Q921I9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Exosc4Q921I9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Exosc4Q921I9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Exosc4Q921I9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Exosc4Q921I9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Exosc4Q921I9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Exosc4Q921I9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Exosc4Q921I9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Exosc4Q921I9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Exosc4Q921I9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Exosc4Q921I9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Exosc4Q921I9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Exosc4Q921I9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Exosc4Q921I9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Exosc4Q921I9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Exosc4Q921I9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Exosc4Q921I9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Exosc4Q921I9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exosc4Q921I9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Exosc4Q921I9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Exosc4Q921I9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Exosc4Q921I9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc4Q921I9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc4Q921I9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Exosc4Q921I9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exosc4Q921I9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Exosc4Q921I9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Exosc4Q921I9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Exosc4Q921I9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Exosc4Q921I9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Exosc4Q921I9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Exosc4Q921I9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Exosc4Q921I9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Exosc4Q921I9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Exosc4Q921I9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Exosc4Q921I9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Exosc4Q921I9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Exosc4Q921I9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Exosc4Q921I9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Exosc4Q921I9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Exosc4Q921I9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Exosc4Q921I9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Exosc4Q921I9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Exosc4Q921I9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Exosc4Q921I9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Exosc4Q921I9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms