Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrc49Q91YK0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc49Q91YK0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc49Q91YK0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc49Q91YK0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc49Q91YK0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc49Q91YK0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrc49Q91YK0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc49Q91YK0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc49Q91YK0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc49Q91YK0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc49Q91YK0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc49Q91YK0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrc49Q91YK0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrc49Q91YK0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc49Q91YK0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc49Q91YK0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc49Q91YK0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc49Q91YK0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc49Q91YK0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc49Q91YK0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc49Q91YK0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc49Q91YK0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc49Q91YK0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc49Q91YK0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc49Q91YK0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc49Q91YK0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc49Q91YK0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc49Q91YK0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc49Q91YK0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc49Q91YK0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc49Q91YK0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc49Q91YK0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc49Q91YK0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc49Q91YK0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc49Q91YK0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc49Q91YK0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc49Q91YK0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc49Q91YK0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc49Q91YK0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc49Q91YK0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc49Q91YK0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc49Q91YK0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc49Q91YK0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc49Q91YK0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrrc49Q91YK0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc49Q91YK0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc49Q91YK0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc49Q91YK0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc49Q91YK0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc49Q91YK0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc49Q91YK0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc49Q91YK0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc49Q91YK0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc49Q91YK0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc49Q91YK0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc49Q91YK0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc49Q91YK0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc49Q91YK0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc49Q91YK0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc49Q91YK0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc49Q91YK0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc49Q91YK0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc49Q91YK0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc49Q91YK0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc49Q91YK0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc49Q91YK0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc49Q91YK0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc49Q91YK0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc49Q91YK0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc49Q91YK0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc49Q91YK0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc49Q91YK0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc49Q91YK0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc49Q91YK0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc49Q91YK0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc49Q91YK0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc49Q91YK0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc49Q91YK0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc49Q91YK0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc49Q91YK0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc49Q91YK0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc49Q91YK0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc49Q91YK0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc49Q91YK0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc49Q91YK0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc49Q91YK0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc49Q91YK0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrc49Q91YK0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrc49Q91YK0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrrc49Q91YK0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc49Q91YK0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc49Q91YK0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc49Q91YK0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc49Q91YK0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc49Q91YK0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc49Q91YK0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc49Q91YK0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc49Q91YK0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc49Q91YK0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms