Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Basp1Q91XV3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Basp1Q91XV3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Basp1Q91XV3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Basp1Q91XV3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Basp1Q91XV3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Basp1Q91XV3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Basp1Q91XV3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Basp1Q91XV3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Basp1Q91XV3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Basp1Q91XV3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Basp1Q91XV3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Basp1Q91XV3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Basp1Q91XV3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Basp1Q91XV3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Basp1Q91XV3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Basp1Q91XV3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Basp1Q91XV3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Basp1Q91XV3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Basp1Q91XV3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Basp1Q91XV3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Basp1Q91XV3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Basp1Q91XV3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Basp1Q91XV3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Basp1Q91XV3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Basp1Q91XV3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Basp1Q91XV3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Basp1Q91XV3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Basp1Q91XV3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Basp1Q91XV3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Basp1Q91XV3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Basp1Q91XV3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Basp1Q91XV3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Basp1Q91XV3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Basp1Q91XV3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Basp1Q91XV3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Basp1Q91XV3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Basp1Q91XV3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Basp1Q91XV3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Basp1Q91XV3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Basp1Q91XV3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Basp1Q91XV3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Basp1Q91XV3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Basp1Q91XV3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Basp1Q91XV3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Basp1Q91XV3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Basp1Q91XV3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Basp1Q91XV3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Basp1Q91XV3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Basp1Q91XV3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Basp1Q91XV3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Basp1Q91XV3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Basp1Q91XV3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Basp1Q91XV3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Basp1Q91XV3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Basp1Q91XV3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Basp1Q91XV3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Basp1Q91XV3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Basp1Q91XV3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Basp1Q91XV3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Basp1Q91XV3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Basp1Q91XV3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Basp1Q91XV3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Basp1Q91XV3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Basp1Q91XV3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Basp1Q91XV3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Basp1Q91XV3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Basp1Q91XV3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Basp1Q91XV3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Basp1Q91XV3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Basp1Q91XV3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Basp1Q91XV3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Basp1Q91XV3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Basp1Q91XV3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Basp1Q91XV3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Basp1Q91XV3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Basp1Q91XV3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Basp1Q91XV3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Basp1Q91XV3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Basp1Q91XV3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Basp1Q91XV3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Basp1Q91XV3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Basp1Q91XV3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Basp1Q91XV3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Basp1Q91XV3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Basp1Q91XV3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Basp1Q91XV3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Basp1Q91XV3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Basp1Q91XV3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Basp1Q91XV3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Basp1Q91XV3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Basp1Q91XV3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Basp1Q91XV3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Basp1Q91XV3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Basp1Q91XV3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Basp1Q91XV3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Basp1Q91XV3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Basp1Q91XV3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Basp1Q91XV3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Basp1Q91XV3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms