Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cbx7Q8VDS3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cbx7Q8VDS3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cbx7Q8VDS3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cbx7Q8VDS3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cbx7Q8VDS3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cbx7Q8VDS3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cbx7Q8VDS3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cbx7Q8VDS3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cbx7Q8VDS3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cbx7Q8VDS3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cbx7Q8VDS3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cbx7Q8VDS3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cbx7Q8VDS3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cbx7Q8VDS3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cbx7Q8VDS3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx7Q8VDS3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx7Q8VDS3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx7Q8VDS3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx7Q8VDS3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cbx7Q8VDS3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cbx7Q8VDS3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cbx7Q8VDS3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx7Q8VDS3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx7Q8VDS3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cbx7Q8VDS3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cbx7Q8VDS3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cbx7Q8VDS3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx7Q8VDS3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx7Q8VDS3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx7Q8VDS3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cbx7Q8VDS3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cbx7Q8VDS3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cbx7Q8VDS3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cbx7Q8VDS3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cbx7Q8VDS3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cbx7Q8VDS3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx7Q8VDS3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cbx7Q8VDS3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cbx7Q8VDS3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbx7Q8VDS3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cbx7Q8VDS3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cbx7Q8VDS3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cbx7Q8VDS3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbx7Q8VDS3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbx7Q8VDS3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx7Q8VDS3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx7Q8VDS3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cbx7Q8VDS3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cbx7Q8VDS3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx7Q8VDS3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx7Q8VDS3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbx7Q8VDS3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx7Q8VDS3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx7Q8VDS3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx7Q8VDS3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx7Q8VDS3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx7Q8VDS3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx7Q8VDS3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cbx7Q8VDS3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cbx7Q8VDS3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cbx7Q8VDS3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cbx7Q8VDS3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cbx7Q8VDS3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cbx7Q8VDS3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cbx7Q8VDS3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cbx7Q8VDS3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx7Q8VDS3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx7Q8VDS3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx7Q8VDS3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cbx7Q8VDS3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cbx7Q8VDS3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx7Q8VDS3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx7Q8VDS3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx7Q8VDS3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cbx7Q8VDS3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cbx7Q8VDS3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx7Q8VDS3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx7Q8VDS3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx7Q8VDS3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cbx7Q8VDS3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cbx7Q8VDS3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cbx7Q8VDS3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cbx7Q8VDS3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cbx7Q8VDS3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cbx7Q8VDS3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cbx7Q8VDS3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cbx7Q8VDS3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cbx7Q8VDS3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cbx7Q8VDS3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cbx7Q8VDS3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cbx7Q8VDS3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cbx7Q8VDS3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cbx7Q8VDS3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cbx7Q8VDS3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cbx7Q8VDS3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cbx7Q8VDS3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cbx7Q8VDS3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cbx7Q8VDS3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cbx7Q8VDS3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms